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powerke木蟲 (小有名氣)
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[求助]
計算機(jī)模擬藥物分子結(jié)構(gòu)的建議
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| 老板讓我學(xué)習(xí)計算機(jī)模擬方面的書，自己設(shè)計一個藥物分子。但是網(wǎng)上的軟件一大堆，各位做過藥物模擬的同學(xué)們給個建議，用哪款軟件？學(xué)學(xué)習(xí)時要注意哪些方面？小弟是做合成的，僅僅就是模擬一個出來自己合成測試活性。 |
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powerke
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4樓2011-04-21 22:00:37
houxuben
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★
powerke(金幣+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金幣+1): 謝謝交流 2011-04-22 17:23:43
powerke(金幣+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金幣+1): 謝謝交流 2011-04-22 17:23:43
| 建議看看徐筱杰的《計算機(jī)輔助藥物設(shè)計》，還有徐文方的《藥物設(shè)計學(xué)》。具體軟件做QSAR建議用SYBYL，當(dāng)然，SYBYL里面還有很多模塊，分子對接、同源模建、動力學(xué)模擬等，不過QSAR做的算是比較好的。藥效團(tuán)建議用catalyst。分子對接建議用GOLD，這個是收費(fèi)的，學(xué)術(shù)版的AUTODOCK也不錯。動力學(xué)可以用GROMCAS。論壇里有很多介紹的。 |
2樓2011-04-21 17:48:10
gancs7894
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3樓2011-04-21 21:55:07
PSA
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5樓2011-04-21 22:46:04
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