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gmy1990榮譽(yù)版主 (著名寫手)
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【gmy個(gè)人文集】自己這段時(shí)間用GaussSum經(jīng)驗(yàn)總結(jié)
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這段時(shí)間接觸GaussSum比較多，前幾天也看到有人問到，這里就談?wù)勎矣龅降囊恍﹩栴}吧 1，用實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)成的GaussSum做DOS圖時(shí)，發(fā)現(xiàn)log文件過大分析不了，下載到最新版本的問題就解決了。 2，經(jīng)常出現(xiàn)cclib has problems parsing ***.log問題，檢查自己的log文件是否完整。 3，關(guān)于做PDOS（重點(diǎn)哈），做單點(diǎn)能計(jì)算時(shí)必須要有pop=full iop(3/33=1,3/36=-1),關(guān)鍵字，這在GaussSum幫助文件和例子里面寫得很詳細(xì)。至于做PDOS的時(shí)候，需要有g(shù)roup.txt文件，選擇做atoms時(shí)，具體的兩個(gè)要求是每個(gè)原子要列出以及所列原子不能重復(fù)，這里我還得補(bǔ)充一點(diǎn)group.txt格式， atoms part1（你所想要分析的某個(gè)分子部分） 1-5,8-20,30（該部分原子序號(hào)） part2 6-7,21-29,31-33（注意了，直接保存就可以，下面不能有空行，我被這個(gè)給整慘了） 在選擇用orbitals時(shí)，大致一樣，唯一不同就是不必列出所有的軌道。 4，就以上例子分析，我要的結(jié)果是part1和part2的PDOS,但GaussSum做出來的part1和part2的圖的結(jié)果是part1和total（圖上顯示的是part2，經(jīng)過數(shù)據(jù)對(duì)比很明顯就是total）或者part2和total（同理），估計(jì)是我下載的軟件bug，但可以從它產(chǎn)生的DOS Spectrum.txt文件（里面有你想要的part1，part2，total）提取數(shù)據(jù)在origin里面作圖，結(jié)果就很好了。 5.在做COOP時(shí)，和做PDOS一個(gè)樣。關(guān)于做其他圖，遇到的問題就沒什么了，只要你的log文件沒錯(cuò)，基本就okay！ [ Last edited by 375642546 on 2011-5-6 at 21:19 ] |
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4樓2011-04-27 17:19:57
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21樓2012-05-15 10:30:41
★★★★★ 五星級(jí),優(yōu)秀推薦
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我現(xiàn)在下載的最新版本里group.txt最后一行可以空，但不能空兩行。還有，group.txt是放在跟 orbital_data.txt, DOS_spectrum.txt, origin_orbs.txt這些文件的同一個(gè)文件夾中。比如說你解壓之后的文件名是gaussum，則group.txt就應(yīng)該放在gaussum\gausssum2.2 中。偶就因?yàn)榘裧roup.txt放在gaussum下，結(jié)果倒騰了半天老提示group.txt not found，希望后學(xué)者不要走偶滴老路。  |
22樓2012-06-12 21:42:57
簡單回復(fù)
gmy19907樓
2011-04-27 21:17
回復(fù)
[ Last edited by gmy1990 on 2011-4-28 at 15:51 ]
sdjgdu13樓
2011-05-07 12:40
回復(fù)
五星好評(píng) 謝謝分享
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