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摻雜的周期性碳納米管， 這樣優(yōu)化設(shè)置對嗎？
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dmol優(yōu)化碳納米管，如圖 1. 這個純的碳納米管優(yōu)化的時候，優(yōu)化了這個supercell的晶格參數(shù)，也就是a， b，c三個方向上夜都做了優(yōu)化 2. 如果這個碳納米管優(yōu)化的時候，如摻雜一個Si原子，那么優(yōu)化的時候還要優(yōu)化晶格參數(shù)嗎，還是只優(yōu)化所有的原子，不用優(yōu)化cell了呢？請給出詳細(xì)的why，或者類似參考文獻(xiàn)？ 3. 追加一個問題，這樣的結(jié)構(gòu)，優(yōu)化的時候，是不是不需要統(tǒng)計頻率呢？論壇中的好多蟲子也都曾討論過這個問題，就是周期性的體系，用dmol優(yōu)化，到底能不能統(tǒng)計頻率呢，如果優(yōu)化結(jié)構(gòu)的時候不選，那么做過渡態(tài)的時候，要驗證有一個對應(yīng)的虛頻怎樣辦呢？ [ Last edited by zsl_321123 on 2011-5-3 at 08:24 ] |
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cenwanglai
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【答案】應(yīng)助回帖
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zsl_321123(金幣+10): 感謝建議，多謝 2011-05-03 21:01:42
zsl_321123(金幣+10): 再送點金幣給你，呵呵。。。 2011-05-08 09:07:29
youzhizhe(金幣+1, 1ST強帖+1): 謝謝交流。 2011-05-09 08:41:19
zsl_321123(金幣+10): 感謝建議，多謝 2011-05-03 21:01:42
zsl_321123(金幣+10): 再送點金幣給你，呵呵。。。 2011-05-08 09:07:29
youzhizhe(金幣+1, 1ST強帖+1): 謝謝交流。 2011-05-09 08:41:19
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首先，cell優(yōu)化比不優(yōu)化原則上精度高。不再優(yōu)化cell都是想在合理精度前提下偷懶。這種偷懶在測試計算證明不影響作出結(jié)論的情況下，是值得鼓勵的。 看你box有多大和摻雜濃度高低。如果box較大而且摻雜濃度很低，如2%以下，摻雜后不優(yōu)化box也是可以接受的。 這種情況下，不再優(yōu)化cell，可以滿足化學(xué)精度，不影響趨勢的判斷。 前提：測試一下，看看晶胞和總能變化大不大。可以接受的變化就忽略吧。 |
2樓2011-05-03 20:47:55
3樓2011-05-03 20:57:18
4樓2011-05-03 20:58:32
flymice
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樓主，我現(xiàn)在也在模擬碳納米管，但是不知道為什么，使用超胞建模后總是不能結(jié)構(gòu)優(yōu)化成功，原因不明，不知道你是怎么建立這個結(jié)構(gòu)的？ 我的帖子在下面，求指導(dǎo)： http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3803839 |
5樓2011-12-05 19:12:11
flymice
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6樓2012-05-08 13:46:29
cenwanglai
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flymice7樓2012-05-08 15:01:19
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8樓2012-05-08 19:13:44
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9樓2012-05-09 12:56:49
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10樓2012-05-09 13:47:31
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