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crystal0714金蟲 (小有名氣)
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[求助]
Gaussview畫出的軌道圖對(duì)金屬的內(nèi)層軌道或者外層軌道的貢獻(xiàn)顯示不出來！
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求助： 各位大蝦有沒有遇過這種情況的， 用Gaussview畫的軌道圖顯示金屬上沒有電子云分布， 但是數(shù)據(jù)分析里卻顯示這個(gè)軌道上的金屬貢獻(xiàn)有 Ni1 49.13% Ni2 44.88% Ni43 5.86% ，具體是金屬的外層軌道（不是價(jià)層軌道）的貢獻(xiàn)，這個(gè)可能是因?yàn)檫x用的基組是SDD基組，它考慮金屬的原子軌道從1s，到價(jià)層的4s，到外層的5s，6s都有，而Gaussview畫軌道圖的時(shí)候似乎只考慮了價(jià)層上4s的貢獻(xiàn)，外層的貢獻(xiàn)都顯示不出來。  我?guī)熋眠�用過Lanl2dz的基組，發(fā)現(xiàn)它考慮金屬的原子軌道只有1s，2s，3s，居然沒有價(jià)層的4s軌道，結(jié)果對(duì)主要是貢獻(xiàn)3s軌道的金屬原子的分子軌道圖也顯示不出來。  也就是說Gaussview畫出的軌道圖對(duì)金屬的內(nèi)層軌道或者外層軌道的貢獻(xiàn)顯示不出來！ 那么軌道圖和軌道貢獻(xiàn)分析不一致，要怎么辦吶？到底是要看哪一個(gè)才正確呢？ |
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 計(jì)算化學(xué) |
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zhangmt
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【答案】應(yīng)助回帖
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gmy1990(金幣+2): 非常感謝你對(duì)論壇的貢獻(xiàn)，獎(jiǎng)勵(lì)一下！ 2011-05-10 12:56:14
crystal0714(金幣+4): 學(xué)習(xí)了 謝謝回復(fù) 2011-09-09 08:21:39
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1、雖然你都使用了lanl2dz或者sdd基組，但是你甚至不知道什么是贗勢(shì)基組，請(qǐng)學(xué)習(xí)一下，什么是贗勢(shì)基組，這樣你就會(huì)知道，贗勢(shì)基組的1s并不是Ni的1s； 2、顯然你連什么是劈裂價(jià)基組是怎么回事也沒弄清楚，所以請(qǐng)學(xué)習(xí)、測(cè)試一個(gè)最簡(jiǎn)單的3-21g基組，弄清楚輸出文件給出的1s 1s 3s 4s 5s6s 7s之類的，跟Ni的1s 2s 3s 4s并不是一一對(duì)應(yīng)的； 3、更加可以確定的是，你根本沒有去查閱SDD或lanl2dz對(duì)你的金屬原子的基組是如何定義的原始文獻(xiàn)，那就更無法得知它們（輸出文件給出的1s 1s 3s 4s之類的，跟Ni原子的1s 2s等）的對(duì)應(yīng)關(guān)系了。 |
2樓2011-05-10 11:34:32
wang0912302
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3樓2011-05-11 11:50:35
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4樓2011-05-12 15:55:59
zhangmt
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zhou2009(金幣+3): 2011-05-13 12:18:56
zhou2009(金幣+3): 2011-05-13 12:18:56
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估計(jì)你沒看懂我說的，換個(gè)方式說一遍： 1、贗勢(shì)是把內(nèi)核層的電子當(dāng)作原子實(shí)的一部分，不再單獨(dú)計(jì)算他們，查手冊(cè)可知，對(duì)于Ni原子而言，采用的是MDF10的贗勢(shì)，也就是內(nèi)層的1s 2s sp的10個(gè)電子都?xì)w入原子實(shí)里了，根本不會(huì)參與你的任何軌道分析的結(jié)果的，至于其他元素，要看sdd的定義，我在最近的一個(gè)帖子中都給出了列表，你也可以直接查看gaussian手冊(cè)中關(guān)于贗勢(shì)的相關(guān)說明，這是第一條，讓你學(xué)習(xí)的內(nèi)容，你應(yīng)該去查資料； 2、劈裂價(jià)層電子也不是一個(gè)STO代表一個(gè)電子的軌道，而是多個(gè)STO組合代表一個(gè)電子的軌道波函數(shù)，所以，需要做個(gè)測(cè)試，隨便寫一個(gè)比如3-21g之類的基組，找個(gè)原子，輸出它的軌道，你就能看出，是多個(gè)STO對(duì)應(yīng)1個(gè)電子軌道的。。比如對(duì)于C的3-21g,輸出文件中的1s雖然對(duì)應(yīng)的是真正的C的1s軌道（因?yàn)閮?nèi)層電子軌道不必裂分，這是pople型基組的定義），但輸出中的2s 3s其實(shí)對(duì)應(yīng)的都是真正C的2s電子，輸出中的2p 3p對(duì)應(yīng)的也都是2p電子而已，根本沒有3s 和3p的事，因?yàn)?-21G中的21代表雙zeta的劈裂基組，所以針對(duì)你舉例中的1s 2s 3s參與的成分，根本就不是Ni的1s 2s 3s，那些個(gè)6s 7s也不是Ni的6s 7s…… 3、因?yàn)槭勤I勢(shì)，所以根本不會(huì)有1s 2s參與，而可能是輸出1s 對(duì)應(yīng)著Ni的3s電子，2s 3s 對(duì)應(yīng)著Ni的4s電子，4s 5s 6s對(duì)應(yīng)著極化或者彌散的5s電子等等。。。別信這些，我就是瞎猜的，給你舉例說明的。至于真正是如何對(duì)應(yīng)的，你必須去查原始文獻(xiàn)，找出sdd或者lanl2dz對(duì)于Ni原子或者你計(jì)算的原子，是如何定義的，是否有劈裂軌道，而且是如何劈裂的，是否有極化，是否有彌散，等等，我就沒時(shí)間替你查文獻(xiàn)了。 我原文中說的這三點(diǎn)，是你要想弄懂你的輸出文件中給出的那些分子軌道中的組成成分中列出的1s 2s 3s 4s等等，對(duì)應(yīng)者真正的原子的3s 4s 等電子之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系，你就必須做的三個(gè)步驟，做到了，你就懂了，做不到，你就弄不清楚或者弄錯(cuò)。 科研，不是老師嚼碎了然后喂給你，而是教給你學(xué)習(xí)的方法，指給你獲取的手段。 上一個(gè)回文中，我既告訴你了要學(xué)習(xí)什么概念，又給出了學(xué)習(xí)的步驟，你如果真的認(rèn)真看了，按照我說的，一步一步去讀，去練，去查，你就會(huì)自己獲取這些知識(shí)，然后豁然貫通，而不會(huì)覺得我是在不友善地“評(píng)論”你。。 順便多說一下，不是針對(duì)你，而是針對(duì)多數(shù)來這里尋求答案的初學(xué)者，要現(xiàn)成的答案，不是真正地學(xué)習(xí)，要學(xué)會(huì)如何尋找答案——像這個(gè)例子，我可以用個(gè)把小時(shí)去讀文獻(xiàn)，然后直接給你結(jié)果，但我想多數(shù)專家都不會(huì)愿意這樣做的，不僅僅是時(shí)間的問題，而是那樣對(duì)你沒什么用處，授之以魚，不如授之以漁。。。你認(rèn)為呢？ |
5樓2011-05-13 03:03:24
crystal0714
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6樓2011-05-13 12:06:52
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