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[交流] 晶體堆積比較的問(wèn)題

文章投稿，兩個(gè)不同晶體分子進(jìn)行解析比較，其中一個(gè)分子的堆積圖能夠很明顯的看到π-π堆積，圖上標(biāo)出π-π環(huán)距離，但是另一個(gè)分子的堆積圖很難看出platon計(jì)算出來(lái)的π-π堆積，這個(gè)圖上不畫(huà)出π-π環(huán)之間作用可以嗎

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1樓 2011-05-20 14:35:12

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Originally posted by jayen3916 at 2011-05-20 14:35:12:
文章投稿，兩個(gè)不同晶體分子進(jìn)行解析比較，其中一個(gè)分子的堆積圖能夠很明顯的看到π-π堆積，圖上標(biāo)出π-π環(huán)距離，但是另一個(gè)分子的堆積圖很難看出platon計(jì)算出來(lái)的π-π堆積，這個(gè)圖上不畫(huà)出π-π環(huán)之間作用可以嗎

如是因?yàn)榻Y(jié)構(gòu)復(fù)雜導(dǎo)致看不出來(lái), 那么可以簡(jiǎn)化一下再畫(huà) (刪除一些無(wú)關(guān)緊要的結(jié)構(gòu)部分).

如果pi-pi比較弱,可以不討論, 不討論,就不畫(huà).

如討論了, 一個(gè)畫(huà), 一個(gè)不畫(huà), 似乎沒(méi)有道理.

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3樓2011-05-20 14:59:15

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Originally posted by xi2004 at 2011-05-20 14:59:15:
如是因?yàn)榻Y(jié)構(gòu)復(fù)雜導(dǎo)致看不出來(lái), 那么可以簡(jiǎn)化一下再畫(huà) (刪除一些無(wú)關(guān)緊要的結(jié)構(gòu)部分).

如果pi-pi比較弱,可以不討論, 不討論,就不畫(huà).

如討論了, 一個(gè)畫(huà), 一個(gè)不畫(huà), 似乎沒(méi)有道理.

拍拍作用力強(qiáng)弱是看Cg-Cg距離嗎？

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4樓2011-05-21 10:19:14

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Originally posted by jayen3916 at 2011-05-21 10:19:14:
拍拍作用力強(qiáng)弱是看Cg-Cg距離嗎？

距離是最主要的判據(jù)。這方面文獻(xiàn)很多。我記得我以前還上載過(guò)一些。不過(guò)我沒(méi)有專(zhuān)門(mén)研究過(guò)，所以也不太熟悉。

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5樓2011-05-21 15:38:21

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aeon8868

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看cg-cg的距離。還有阿爾法、貝塔角。阿爾法小于20度，貝塔小于30度，環(huán)距離小于4.2。

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6樓2011-05-29 09:30:28

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Originally posted by aeon8868 at 2011-05-29 09:30:28:
看cg-cg的距離。還有阿爾法、貝塔角。阿爾法小于20度，貝塔小于30度，環(huán)距離小于4.2。

Cg(I) Res(I) Cg(J)  [ ARU(J)]    Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S    Alpha  Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp  Slippage

Cg(1)  [ 1] -> Cg(5)  [  4655.01]    5.0745  0.9222 0.3308-0.2003  12.6915 61.278 51.18 38.84    -3.9523    3.1809
Cg(4)  [ 1] -> Cg(4)  [  3656.01]    5.7999  0.3746-0.9081-0.1871 2.2303       0 38.54 38.54    -4.5362    -4.5362 3.614
Cg(4)  [ 1] -> Cg(5)  [  4555.01]    4.9872  0.9222 0.3308-0.2003    3.463185.264 15.82 81.60    -0.7284    4.7983
Cg(5)  [ 1] -> Cg(1)  [  4454.01]    5.0745  0.7715 0.6245 0.1215    1.419361.278 38.84 51.18    3.1809    -3.9523
Cg(5)  [ 1] -> Cg(5)  [  3655.01]    4.8269 -0.9222 0.3308 0.2003  -6.2144       0 48.47 48.47    3.2005    3.2005 3.613
這里面的幾個(gè)作用力應(yīng)該都算是弱的吧，像這么弱的作用力在文章中需要客觀的提出來(lái)嗎？

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7樓2011-05-29 13:07:23

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lichao-1988

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Originally posted by aeon8868 at 2011-05-29 09:30:28:
看cg-cg的距離。還有阿爾法、貝塔角。阿爾法小于20度，貝塔小于30度，環(huán)距離小于4.2。

請(qǐng)問(wèn)一下量?jī)蓚€(gè)環(huán)的距離的時(shí)候選擇哪個(gè)原子呢，是找距離最近的嗎？

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8樓2011-07-15 09:07:08

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lichao-1988

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Originally posted by jayen3916 at 2011-05-29 13:07:23:
Cg(I) Res(I) Cg(J) [ ARU(J)] Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S Alpha Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp Slippage

Cg(1) [ 1] -> Cg(5) [ 4655.01] 5.0745 0.9222 ...

我想請(qǐng)問(wèn)一下，這個(gè)表是怎么做出來(lái)的呢？

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9樓2011-07-15 09:11:19

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shuohuoboy

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453004樓: Originally posted by aeon8868 at 2011-05-29 09:30:28
看cg-cg的距離。還有阿爾法、貝塔角。阿爾法小于20度，貝塔小于30度，環(huán)距離小于4.2。

請(qǐng)教一下您說(shuō)的那個(gè)α，β角是怎么量取的？

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10樓2013-03-08 09:53:16

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liwenjun182樓

2011-05-20 14:55 回復(fù)

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