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yexuqing木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
太陽系系主任
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利用數(shù)據(jù)庫確定蛋白結(jié)構(gòu)的新方法 已有6人參與
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利用數(shù)據(jù)庫確定蛋白結(jié)構(gòu)的新方法 由于“蛋白數(shù)據(jù)庫”(Protein Data Bank)現(xiàn)已有超過6萬個(gè)結(jié)構(gòu)，所以經(jīng)常有可能創(chuàng)建基于同源性的模型，來幫助確定具有一個(gè)未知三維結(jié)構(gòu)的某一蛋白的X-射線晶體結(jié)構(gòu)。但當(dāng)人們所感興趣的蛋白的序列與已知結(jié)構(gòu)的符合程度不到30%時(shí)，當(dāng)前的方法通常會(huì)失敗。一種能夠克服這一局限性的新方法已經(jīng)建立，并成功地用在了13個(gè)X-射線衍射數(shù)據(jù)集的8個(gè)當(dāng)中，它們用傳統(tǒng)方法是不能得到解析的。只要分辨率為3.2�；蚋谩⒃诜菍�(duì)稱單元中有四個(gè)或更少的版本、且已有“序列身份”(sequence identity)符合度超過20%的同源蛋白的結(jié)構(gòu)，那么在當(dāng)前方法會(huì)失敗的一半以上的情形中，該新方法應(yīng)能在沒有實(shí)驗(yàn)“相信息”(phase information)的情況下快速確定蛋白的結(jié)構(gòu)。 Letters to Nature p.540 doi:10.1038/nature09964 要約 全文 PDF |
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4樓2011-05-28 09:52:43
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