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1樓 2011-05-26 11:23:41

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mike0601

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御劍江湖(金幣+2): xiexie 2011-05-26 23:42:41
superfcc(金幣+4): 2011-05-27 08:08:41

在優(yōu)化的基礎(chǔ)上在優(yōu)化可能沒(méi)什么用了，不如設(shè)置優(yōu)化的步數(shù)再多一些，或者做個(gè)模擬退火什么的

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2樓2011-05-26 23:04:05

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superfcc(金幣+3): 2011-05-27 09:38:35
zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-05-27 22:45:53

引用回帖:

Originally posted by superfcc at 2011-05-27 09:09:15:
模擬退火對(duì)分子有要求嗎？如果不是藥物大分子，比如說(shuō)苯并咪唑類(lèi)的小分子也可以模擬退火嗎？總體感覺(jué)，結(jié)構(gòu)越簡(jiǎn)單越是不好優(yōu)化！

小分子也可以。分子簡(jiǎn)單優(yōu)化的更快才對(duì)

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4樓2011-05-27 09:33:30

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5樓2011-05-27 09:41:47

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superfcc(金幣+2): 2011-05-27 14:50:22

引用回帖:

Originally posted by superfcc at 2011-05-27 09:41:47:
謝謝，我的分子是在COMMOND console 中輸入分子的SLN 直接得出的，可能結(jié)構(gòu)比較好了，然后優(yōu)化會(huì)顯示能量上升（energy rose）！不過(guò)我剛才模擬退火后，優(yōu)化就行了！不過(guò)模擬退火是第一次用，不知道參數(shù)設(shè)置有什 ...

這個(gè)我也不太懂，還得自己去研究探索

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6樓2011-05-27 13:31:21

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