feverforce

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[求助] 求助高手看看這個(gè)DL_POLY的FIELD文件有什么問題

FIELD內(nèi)容如下：
ZEOLITE  ZSM5 (SILICALITE) SAUER MODEL (SANS SHELL) + BENZENE
UNITS KJ
MOLECULES 2
ZEOLITE  ZSM5 (SILICALITE)
NUMMOLS 1
ATOMS 288
Si          28.0855    4.000 96 0
O          15.9994    -2.000  192 0
FINISH
BENZENE
NUMMOLS 1
ATOMS 12
C          12.0000    -0.075 6 0
H             1.008    +0.075 6 0
RIGID  1
12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
FINISH
VDW  5
Si    Si    buck       0.00 0.30017
O    O    buck       0.00 0.30017
Si    O    buck 149643.89 0.30017
C    O    12-6    1.335E6    1807.0
H    O    12-6    1.599E5    510.8
TBP  1
O    Si    O    SHRM    17.7504  109.4666667    0.32769    0.32769       2.0
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運(yùn)行總是說“error - end of FIELD file encountered”，我是新手看不出有啥問題，想向各位大牛求助//bow

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1樓 2011-05-26 14:32:24

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feverforce(金幣+1): 謝謝交流 2011-05-26 20:17:36
御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-05-26 22:45:51

這好像是DL_POLY tutorial里面的一個(gè)case。出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤的原因一般是由于你CONFIG文件里各原子坐標(biāo)的順序與FIELD文件里定義的不匹配。把你的CONFIG貼出來看看。

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2樓2011-05-26 16:48:48

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Originally posted by winterz at 2011-05-26 16:48:48:
這好像是DL_POLY tutorial里面的一個(gè)case。出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤的原因一般是由于你CONFIG文件里各原子坐標(biāo)的順序與FIELD文件里定義的不匹配。把你的CONFIG貼出來看看。

嗯，這個(gè)是TEST6里面的，CONFIG里面原子出現(xiàn)的順序也是Si, O, C, H

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3樓2011-05-26 20:16:57

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
feverforce(金幣+2): 2011-05-26 21:52:57
御劍江湖(金幣+2): 謝謝 2011-05-26 22:46:06

我看著沒什么問題，在我這里用DLPOLY 2.20運(yùn)行是正常的。附件中是輸入文件和結(jié)果。

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4樓2011-05-26 20:50:18

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Originally posted by winterz at 2011-05-26 20:50:18:
我看著沒什么問題，在我這里用DLPOLY 2.20運(yùn)行是正常的。附件中是輸入文件和結(jié)果。

謝謝您的耐心，我用的是DL_POLY 4.01.1，難道是版本的問題？我測(cè)試TEST9是可以運(yùn)行的……

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5樓2011-05-26 21:52:36

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御劍江湖(金幣+2): 謝謝 2011-05-26 22:46:15
feverforce(金幣+2): 2011-05-26 23:10:51

DL_POLY 4好像還不支持rigid body算法，如果你的體系不是特別大，還是建議使用DL_POLY 2。

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6樓2011-05-26 22:38:30

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Originally posted by winterz at 2011-05-26 22:38:30:
DL_POLY 4好像還不支持rigid body算法，如果你的體系不是特別大，還是建議使用DL_POLY 2。

嗯，謝謝你的建議~

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7樓2011-05-26 23:10:40

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Originally posted by winterz at 2011-05-26 20:50:18:
我看著沒什么問題，在我這里用DLPOLY 2.20運(yùn)行是正常的。附件中是輸入文件和結(jié)果。

Si Si BUCK 0.00 0.30017

關(guān)于這鍵勢(shì)能這句。
我想問下，按照手冊(cè)的說法，buck模型應(yīng)該是三參數(shù)的，A, C ,rho,為什么這個(gè)例子里只給了兩個(gè)變量的值。我是新手，請(qǐng)大俠指教

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8樓2011-07-15 10:38:28

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引用回帖:

Originally posted by huanghl2010 at 2011-07-15 10:38:28:
Si Si BUCK 0.00 0.30017

關(guān)于這鍵勢(shì)能這句。
我想問下，按照手冊(cè)的說法，buck模型應(yīng)該是三參數(shù)的，A, C ,rho,為什么這個(gè)例子里只給了兩個(gè)變量的值。我是新手，請(qǐng)大俠指教

buck模型是有三個(gè)參數(shù)，在FIELD中對(duì)應(yīng)的順序?yàn)锳，rho，C。這行語句中沒有寫C，C的值便設(shè)為0。
這個(gè)例子中作者對(duì)沸石骨架使用的力場(chǎng)模型是由J. Sauer組提出來的。他們的模型中便忽略了Buckingham勢(shì)中的 -C r^(-6)項(xiàng)。你可以看下這個(gè)力場(chǎng)的原始文獻(xiàn)：J. Phys. Chem. 1996, 100, 11043-11049

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9樓2011-07-15 15:19:54

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Originally posted by winterz at 2011-07-15 15:19:54:
buck模型是有三個(gè)參數(shù)，在FIELD中對(duì)應(yīng)的順序?yàn)锳，rho，C。這行語句中沒有寫C，C的值便設(shè)為0。
這個(gè)例子中作者對(duì)沸石骨架使用的力場(chǎng)模型是由J. Sauer組提出來的。他們的模型中便忽略了Buckingham勢(shì)中的 -C r^( ...

謝謝您啊

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10樓2011-07-15 16:35:20

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