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[求助]
①Dyella marensis為何菌？②Biolog菌種鑒定問題。
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①如題，百度未搜到Dyella marensis為何菌，GOOGLE上說是Dyella屬的新種，蟲友們是否知道它的中文名是什么，還是它還未有中文名？在網(wǎng)上看了伯杰氏細(xì)菌系統(tǒng)分類學(xué)手冊的附錄2（該書我們這里木有，所以只能在網(wǎng)上看其中一部分），在該附錄中未有Dyella這個屬 ，急切想知道它的中文名以及屬于哪一科、哪一目、哪一綱。 ②關(guān)于Biolog菌種自動鑒定儀，我用的是GENIII的微平板，IF-A的接種液，每孔接種量為100μl，濁度大概為95%，接種后分別在24h、48h、64h時間點用電腦檢測菌株對碳源的利用情況。但是結(jié)果都是顯示No ID:False Positive，然后下面提示說：Retest with Lower Inoculum(T98) or Protocol B。這時候該怎么做呢？是不是還要培養(yǎng)長一點的時間呢。False Positive指的是什么意思咧？ ③我重新用了比之前更少的接種量進(jìn)行檢測，但是還是出現(xiàn)上述情況，不過，下面列出的幾個可能的菌種剛好是我想要的結(jié)果，這樣的結(jié)果是否可用呢？有哪位蟲友也做這個的可否幫忙分析下。謝謝。  |
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嘿嘿，我想問的是：
4樓2011-05-30 12:36:27
yguang
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
rainwander(金幣+2): 鼓勵交流 2011-05-30 08:06:37
Virginiaの(金幣+2): 呵呵，這也是我Google上看到的。 2011-05-30 12:28:33
rainwander(金幣+2): 鼓勵交流 2011-05-30 08:06:37
Virginiaの(金幣+2): 呵呵，這也是我Google上看到的。 2011-05-30 12:28:33
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Int J Syst Evol Microbiol. 2009 Jun;59(Pt 6):1397-400. Dyella marensis sp. nov., isolated from cliff soil. Lee DW, Lee SD. SourceDepartment of Science Education, Cheju National University, Jeju 690-756, Republic of Korea. Abstract A novel, Gram-negative bacterium, designated CS5-B2(T), was isolated from soil that had been collected from a cliff on Mara Island, Republic of Korea. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences showed that the strain fell within the radiation of the genus Dyella. The closest relatives were the type strains of Dyella koreensis, Dyella ginsengisoli and Dyella japonica and 16S rRNA gene sequence similarities between strain CS5-B2(T) and these strains were 99.0, 97.9 and 97.8 %, respectively. The sequence similarities between the novel isolate and other related taxa compared in the phylogenetic analysis were less than 96.7 %. The cells of strain CS5-B2(T) were aerobic, oxidase-negative, catalase-positive, motile rods. The temperature range for growth was 20-37 degrees C, with optimal growth at 30-37 degrees C. Growth occurred at pH 5.1-9.1, with optimal growth at pH 6.1-9.1. NaCl tolerance for growth was from 1 to 2 % (w/v). Ubiquinone-8 was the predominant respiratory lipoquinone. The major fatty acids were iso-C(15 : 0) and iso-C(17 : 1)omega9c. The G+C content of the DNA was 65.7-66.6 mol%. The level of DNA-DNA relatedness with D. koreensis KCTC 12359(T) was 20.2 and 29.6 % in duplicate measurements. On the basis of phenotypic features, phylogenetic analysis and DNA-DNA relatedness, a novel species of the genus Dyella is proposed, with the name Dyella marensis sp. nov. The type strain is CS5-B2(T) (=JCM 14959(T) =KCTC 22144(T)). |
2樓2011-05-30 07:42:08
wolfebst
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3樓2011-05-30 10:48:25
wolfebst
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【答案】應(yīng)助回帖
★
Virginiaの(金幣+3): 謝謝。 2011-05-30 15:25:59
amisking(金幣+1): 鼓勵應(yīng)助 2011-05-30 19:50:33
Virginiaの(金幣+3): 2011-05-31 13:41:19
Virginiaの(金幣+3): 謝謝。 2011-05-30 15:25:59
amisking(金幣+1): 鼓勵應(yīng)助 2011-05-30 19:50:33
Virginiaの(金幣+3): 2011-05-31 13:41:19
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1. Proteobacteria門；Gammaproteobacteria綱；Xanthomonadales目；Xanthomonadaceae科；Dyella屬 2. 當(dāng)DIS小于5.0，SIM大于0.75時為良好的匹配；SIM值越接近1，鑒定結(jié)果的可靠性越高 |
5樓2011-05-30 12:57:31
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