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甜酒慢品金蟲(chóng) (初入文壇)
小木蟲(chóng)
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[求助]
基因組提取
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| 我用了老板從國(guó)外帶回來(lái)的一種光合細(xì)菌提取基因組,菌名為chloroflexus,但是用CTAB法提的時(shí)候發(fā)現(xiàn)它出現(xiàn)一種黏黏的東西,以至于提不出基因組。由于資料顯示該菌是革蘭氏陰性的,所以我尚未用溶菌酶處理,大家有誰(shuí)有過(guò)相似經(jīng)歷,或者有好的解決辦法,幫我解決一下,好嗎?不甚感激! |


木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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銅蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
新蟲(chóng) (初入文壇)
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1. 粘稠物質(zhì)為多糖;可以加溶菌酶,但對(duì)G-菌而言,效果并不明顯,CTAB就已經(jīng)夠了; 2. 發(fā)酵液離心后收集菌體,再用STE懸浮菌體,再離心收集; 3. 減少菌體的用量或加大裂解液的用量; 4. CTAB溫浴后最好冷卻至室溫或4度再抽提;酚/氯仿至少抽提2次,建議加入酚/氯仿后橫握離心管,以平放的8字形搖動(dòng)離心管,這樣既可充分使有機(jī)相/無(wú)機(jī)相混勻,又不至于使DNA斷裂成小片段,持續(xù)不短于5min; 5. 吸取水相時(shí)要注意不吸上沉淀,這個(gè)你懂的; 6. 最后沉淀時(shí)加入異丙醇,混勻后室溫靜置10min,吸/撈出絮狀沉淀,溶于TE或水,OD260/280應(yīng)該在1.9左右。 |
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