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[交流]
MS生成的石墨烯和納米管導(dǎo)出后使用vmd的問題 已有2人參與
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各位兄弟，我使用MS建了納米管和石墨烯，并且已經(jīng)將石墨烯和納米管結(jié)合，在納米管和石墨烯結(jié)合時(shí)刪掉了石墨烯適當(dāng)?shù)脑�，�?dǎo)出文件時(shí)pdb格式的，使用vmd加載時(shí)可以成功加載，可是生成psf文件時(shí)，vmd出了問題： 而且我在直接雙擊導(dǎo)出的pdb文件，也是打不開的： 沒辦法了，我只有先加載導(dǎo)出的pdb文件，然后生成了一個(gè)pdb文件，并命名為1.pdb，當(dāng)我使用graph.pdb再生成psf文件時(shí)，又出現(xiàn)了問題： 生成psf文件我是這樣寫的pgn文件： package require psfgen topology top_all27_prot_lipid.inp pdbalias residue HIS HSE pdbalias atom ILE CD1 CD segment U {pdb graph.pdb} coordpdb graph.pdb U guesscoord writepdb graphi.pdb writepsf graphi.psf 各位兄弟，幫我分析一下吧，我能力有限，期待兄弟們的回復(fù)，先謝謝了。 |
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