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30937747木蟲 (小有名氣)
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[求助]
[求助]高保真酶擴(kuò)不出來
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| 我提取RNA做反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,以cDNA為模板做PCR,用普通taq酶擴(kuò)出來的片段很亮,而且專一性很好,但是換高保真酶都擴(kuò)不出來,換了兩種酶,溫度梯度和濃度梯度都做了,延伸的時(shí)間也增長(zhǎng)了一倍.但是就是沒有結(jié)果,請(qǐng)問有什么好的建議嗎? |

木蟲 (小有名氣)
拿著掃把的研究僧

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樓主是想做一些基因下游實(shí)驗(yàn)吧,Taq酶的活性確實(shí)要比高保真酶的活性強(qiáng),這是公認(rèn)的。鑒于這種情況,給你兩種可供選擇的Protocol: 1,若果你的目的片段不大,1-2.5kb,可以先用好一點(diǎn)的Taq酶擴(kuò)增了,上質(zhì)粒,測(cè)序沒有突變后,然后再用pfu酶或Phusion等高保真酶進(jìn)行亞克; 2、如果樓主覺得上面這個(gè)方案麻煩,你可以在你的高保真酶中加入少量的高質(zhì)量的Taq酶,記住是質(zhì)量好的Taq酶,然后參照高保真酶的反應(yīng)條件進(jìn)行擴(kuò)增,也許這可以解決你的問題 Bless you! |
木蟲 (正式寫手)
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"我的序列是未知的,所以才做反轉(zhuǎn)錄,所以我無法確定是否突變.才必須要用高保真酶.請(qǐng)問哪種taq酶比較好?" 你的序列是未知的是指不知道是什么微生物,還是不知道這個(gè)“微生物分離株”的特有序列,如果是前者,你可以用先用一般的taq酶(可以找promega或invitrogen公司的不錯(cuò))進(jìn)行隨機(jī)擴(kuò)增,在根據(jù)獲得的序列設(shè)計(jì)特異性引物去擴(kuò)增,這時(shí)候就可以選用高保真酶(前面提到的幾個(gè)公司都有,但價(jià)錢比較貴),不過都是pfu酶及其衍生系列。如果知道是什么微生物,就可以根據(jù)該屬的微生物已上傳的序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行擴(kuò)增。后面這種情況會(huì)順利很多。 |
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