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baiyuefei版主 (文學泰斗)
風雪
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[求助]
請教氫鍵問題？金幣不是問題可再加，幫幫忙啊
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2個月前投了個Journal of Molecular Structure，今返回讓大修。氫鍵處有些問題。在文章中我寫的氫鍵表（Platon計算）如下： D-H…A d(D-H) d(H…A) d(D…A) <(DHA) C(22)-H(22)…O(2)i 0.93 2.52 3.428(9) 165.9 C(11)-H(11)…N(3) 0.98 2.38 2.968(5) 117.8 C(28)-H(28A)…pi(benzene ring) 2.786 請問1我這個晶體中是否存在的這三個作用力呢？請準確回答。是不是不存在啊？我自己都不敢確定。我該怎么回答審稿人的問題啊。本人非晶體專業(yè)，麻煩各位朋友了，金幣不夠可再加，先謝謝大家  （最后統(tǒng)一發(fā)放）審稿人關(guān)于氫鍵提出的問題如下： （1）Characterization of non-covalent interactions. Authors should also provide more arguments on why they think that CH…N bond with almost 3 Å length is a strong one ("There is a strong intramolecular hydrogen bond, C(11)-H(11)…N(3) forming a six-membered ring."  . This interaction is commonly believed to be a weak one. This would be also interesting if authors can do some computational investigation to estimate the energy of this bond in order to classify its strength. To evaluate CH…N and CH…（2）Amide bond C-N. "The corresponding distances of C(23)-N(2) at the optimized geometry in two molecules are 1.378 Å, 1.382 Å respectively which are also shorter than the normally experimental C-N single bond length". This sentence is misleading since C-N bond in non-aromatic amides is aprox. 1.325-1.346 Å [7] and it is shorter due to n? 我的晶體所說有數(shù)據(jù)在下面的即得網(wǎng)盤里： https://good.gd/1284907.htm |
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2樓2011-06-14 12:48:11
【答案】應(yīng)助回帖
baiyuefei(金幣+20): 2011-06-21 12:00:50
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你做的是有機上的東西吧 最好能把CIF 或RES文件傳上來 才容易看清楚 審稿人的大概意思我理解為 1. C(11)-H(11)…N(3) 鍵太短，只有3A，你看下晶體結(jié)構(gòu)是否有別的作用力的推動或者干擾 2. C(23)-N(2)鍵太短 也是需要你做出解釋 因為具體的結(jié)構(gòu)看不到 只能說這么多了，一般來說 原子半徑或者原子之間的距離，在解結(jié)構(gòu)的時候都有一定的范圍 你最好去問下當時結(jié)晶體的人，看看是怎么說的 |
3樓2011-06-14 15:20:21
baiyuefei
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4樓2011-06-14 15:38:08
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5樓2011-06-14 17:40:19
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，那我該怎么修改呢，把這個氫鍵直接刪掉還是我改寫成是弱氫鍵呢，因為氫鍵角差的太多了呢？ 6樓2011-06-14 17:51:58
lijunjie84
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7樓2011-06-15 21:12:59
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