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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 藥學 » 天然藥物化學 » 如何確定該結構的相對構型
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wenyisj金蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何確定該結構的相對構型
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 各位大俠幫忙看一下，如何確定改結構的相對構型？noesy我也做了，但是發(fā)現(xiàn)還是定不了。各位有什么高見？ |
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xiaoxiao270
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7樓2011-06-17 11:02:57
xiaoxiao270
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【答案】應助回帖
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novus(金幣+1, EPI+1): 多謝指教！ 2011-06-15 19:52:24
novus(金幣+1, EPI+1): 多謝指教！ 2011-06-15 19:52:24
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鏈上的這個手性碳除了單晶和Mosher定不了，發(fā)文章非得要你定的話你就只能和文獻進行碳譜比對. 六圓環(huán)為船式構象，而且鏈必須在平伏鍵上，這樣3位和6位就確定了。 5位甲基如果沖外的話可能會與3位H有弱相關，（也可能沒有）如果沒有的話，4位的兩個H是不一樣的，你搭模型可以知道當它和3位H偶合時候偶合常數(shù)不一樣，可以看5位甲基和這兩個H的相關哪個比較強（可能都有相關），可以確定5位的相對構型。 絕對構型的話你可以嘗試水解后做Mosher或單晶。（采用酶水解） 最后請問下你這個化合物從哪個植物里分到的？ |
2樓2011-06-15 19:06:47
stevenabing
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【答案】應助回帖
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wenyisj(金幣+1): 2011-06-16 23:56:46
jiangchunyong(金幣+1): 謝謝！ 2011-06-17 00:05:23
wenyisj(金幣+1): 2011-06-16 23:56:46
jiangchunyong(金幣+1): 謝謝！ 2011-06-17 00:05:23
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單晶衍射也不一定能解決問題，因為第一你的化合物中最重的原子是O，所以要確定絕對構型，最起碼測定時要用銅靶，其產(chǎn)生的X-射線波長比現(xiàn)在最常見的Mo靶要長些，這只是一個必要條件，其次，還得看你的晶體質量，若晶體質量好，又用Cu靶，得到的flack因子接近零，那么就可以確定絕對構型，但是還有一點你的化合物必須是光學純樣品，那么通過單晶衍射確定的絕對構型公信度最好，最可靠。 通過單晶衍射必須獲得晶體，若無法獲得晶體，就可以用其他方法，你的化合物可以嘗試水解后用mosher方法測定。 |
3樓2011-06-16 08:38:24
wenyisj
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首先，謝謝您，這么用心的分析我的化合物。 1 鏈上的手性碳，文獻中只報道了苷元，結果兩種情況下該碳的化學位移是相同的，所以，它的構型定不下來（絕對和相對） 2，鏈未必在平伏鍵上，只是通過文獻苷元的相對構型，畫的這個，可是通過搭模型，發(fā)現(xiàn)這個環(huán)已經(jīng)是剛性船式構象，在橋環(huán)向外的情況下，鏈也向外，所以，其他幾個位置還是無法定（3和6） 3,5位甲基找不到和3位H的noesy，很感謝這個從耦合常數(shù)區(qū)分兩個secH的方法 4，至于植物，不好意思，不方便透漏，不過，這類型的化合物現(xiàn)在分到的并不多，應該不超過5個，其苷元多是從煙草揮發(fā)性成分中分到。 再次，謝謝您的建議。 |
4樓2011-06-16 23:56:03
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