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[交流] 如何控制內(nèi)存需求

在計算能帶時，發(fā)現(xiàn)內(nèi)存需求過大。一個124個原子的超晶胞已經(jīng)超出了48G（節(jié)點的最大內(nèi)存），感覺不太正常，請問怎么通過一些設(shè)置來控制一下內(nèi)存需求？

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1樓 2011-06-17 16:23:31

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nkleof(金幣+1): 謝謝討論！ 2011-06-17 16:51:05
zzy870720z(金幣+1): 鼓勵交流 2011-06-22 10:05:53

設(shè)置如下參數(shù)據(jù)說可以節(jié)省內(nèi)存：
ISYM=0
NPAR=1

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2樓2011-06-17 16:35:52

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zzy870720z(金幣+2): 謝謝指教 2011-06-22 10:06:12

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Originally posted by uuv2010 at 2011-06-17 16:35:52:
設(shè)置如下參數(shù)據(jù)說可以節(jié)省內(nèi)存：
ISYM=0
NPAR=1

謝謝建議，NPAR應(yīng)該是可以節(jié)省內(nèi)存的，每次只計算一條能帶。不過ISYM=0是不利用對稱性，這應(yīng)該是很費內(nèi)存的。
我在INCAR里已經(jīng)設(shè)置了NPAR=1，NSIM=1，結(jié)果和這兩個標簽都大于1的情況沒什么變化，內(nèi)存需求并沒降低。

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4樓2011-06-17 16:50:45

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06022043

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nkleof(金幣+2): 謝謝建議！ 2011-06-17 18:14:41

是不是應(yīng)該減少K點呢。畢竟原子比較多。

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5樓2011-06-17 17:46:07

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計算能帶的時候，采用line模式，這種情況下k點的數(shù)量和內(nèi)存會有關(guān)系嗎，求澄清。我覺得如果是一個一個k點算的話，應(yīng)該不會對內(nèi)存有影響。

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6樓2011-06-17 18:16:03

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mazuju028(金幣+1): 謝謝交流 2011-06-19 09:33:17

引用回帖:

Originally posted by nkleof at 2011-06-17 16:50:45:
謝謝建議，NPAR應(yīng)該是可以節(jié)省內(nèi)存的，每次只計算一條能帶。不過ISYM=0是不利用對稱性，這應(yīng)該是很費內(nèi)存的。
我在INCAR里已經(jīng)設(shè)置了NPAR=1，NSIM=1，結(jié)果和這兩個標簽都大于1的情況沒什么變化，內(nèi)存需求并沒 ...

vasp手冊上是這么說明ISYM的：
Switch of symmetrisation (ISYM=0). Symmetrisation is done locally on each node requiring three huge arrays. VASP.4.4.2 (and newer versions) have a switch to run a more memory conserving symmetrization. This can be selected by specifying ISYM=2. Results might however differ somewhat from ISYM=1 (usually only 1/100th of an meV).

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7樓2011-06-17 18:38:54

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Originally posted by uuv2010 at 2011-06-17 18:38:54:
vasp手冊上是這么說明ISYM的：
Switch of symmetrisation (ISYM=0). Symmetrisation is done locally on each node requiring three huge arrays. VASP.4.4.2 (and newer versions) have a switch to run ...

對啊，如果采用ISYM=2的話，利用原胞的對稱性，就會節(jié)省很多內(nèi)存。采用ISYM=0的話，就放開對稱性，每個原子都需要進行計算，內(nèi)存消耗就會大很多。

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8樓2011-06-21 23:13:57

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zzy870720z(金幣+2): 謝謝指教 2011-06-22 10:06:42
nkleof(金幣+5): 非常感謝，這個建議是很有效的。 2011-06-22 17:07:24

用line模式的話，k點的數(shù)目對內(nèi)存影響特別大。你可以幾個幾個算一次，然后連起來。
總的來說與內(nèi)存相關(guān)的有k點，還有你的grid（一般通過PREC這個來控制的，也可以改變NXG等），另外對line模式與并行計算的核成正比，其他情況并行的話內(nèi)存增加的不多

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9樓2011-06-22 09:29:34

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dxcharlary

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124個原子，你用了多少k點，估計3*3*3都很難承受得了。

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10樓2011-06-22 11:48:46

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Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124個原子，你用了多少k點，估計3*3*3都很難承受得了。

我算過168個原子的體系，也是并行的，內(nèi)存是64G的但是還沒用完，我對每個路徑算一次，每個路徑算的時候取20個k點，分開算是沒任何問題的

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11樓2011-06-22 14:05:27

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Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124個原子，你用了多少k點，估計3*3*3都很難承受得了。

vasp的并行效率很高，如果有cpu夠多的話，1000的原子也可以。
機器空閑的時候測試過。

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12樓2011-06-22 14:24:01

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Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124個原子，你用了多少k點，估計3*3*3都很難承受得了。

做靜態(tài)計算的時候，用了6*6*6的網(wǎng)格。

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13樓2011-06-22 17:08:10

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