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飯飯316新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助chem3D溶質(zhì)與溶劑對(duì)接問(wèn)題
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| 各位大蝦，我因?yàn)橐鋈軇┬?yīng)的量化計(jì)算，因此要對(duì)溶質(zhì)和溶劑進(jìn)行對(duì)接處理，可是我不會(huì)，想請(qǐng)教各位大蝦下，怎么用chem3D進(jìn)行對(duì)接呢？ |
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sobereva
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gmy1990(金幣+3): 非常感謝你對(duì)論壇的貢獻(xiàn)，獎(jiǎng)勵(lì)一下！ 2011-07-02 21:01:57
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Chem3D的dock是基于幾何限制進(jìn)行的，令原子對(duì)兒之間的距離盡可能滿足期望的距離。先在一個(gè)窗口內(nèi)弄出兩個(gè)或多個(gè)分子，然后將要dock的兩個(gè)分子中相對(duì)應(yīng)的原子對(duì)兒選上，點(diǎn)右鍵-display distance measurement，然后將optimal寫上dock之后的預(yù)期數(shù)值。反復(fù)如此至少設(shè)定三對(duì)兒。之后view-dock即可。 由于這種對(duì)接很糙，有必要再進(jìn)行優(yōu)化。 |
2樓2011-07-02 20:49:16
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