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謝開(kāi)龍金蟲(chóng) (小有名氣)
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華大基因發(fā)布生物信息學(xué)軟件
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華大基因發(fā)布生物信息分析軟件SOAP(Short Oligonucleotide Analysis Package) 七月六日,華大基因生物信息軟件發(fā)布會(huì)在深圳舉行。會(huì)上發(fā)布的生物信息軟件是華大基因自主研發(fā)且廣受業(yè)界歡迎的工具升級(jí)及擴(kuò)展之最新力作,它們將為生物學(xué)家提供強(qiáng)有力的解決方案,使研究者能夠更加方便地使用這些生物信息學(xué)工具進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及分析。 本次發(fā)布的生物信息軟件主要包括三個(gè)方面:基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析工具、群體遺傳學(xué)分析工具和傳統(tǒng)工具的優(yōu)化升級(jí)版。華大基因科學(xué)技術(shù)部門(mén)負(fù)責(zé)人李英睿表示:“隨著生物信息學(xué)在生命科學(xué)領(lǐng)域的作用日趨重要,生物信息學(xué)分析軟件已成為生物學(xué)工作者做研究的必備工具。全新升級(jí)版的軟件增加了多項(xiàng)新的功能,具有穩(wěn)定性好、效率高等優(yōu)點(diǎn),可以支持動(dòng)植物、微生物及人類疾病等領(lǐng)域的個(gè)體及群體多組學(xué)研究。通過(guò)這些軟件工具可以對(duì)海量的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、處理,使之成為具有明確生物學(xué)意義的信息,從而使人們能夠更加深入地了解生物的起源、遺傳、發(fā)育與進(jìn)化的本質(zhì)! introduction SOAP has been in evolution from a single alignment tool to a tool package that provides full solution to next generation sequencing data analysis. Currently, it consists of a new alignment tool (SOAPaligner/soap2), a re-sequencing consensus sequence builder (SOAPsnp), an indel finder ( SOAPindel ), a structural variation scanner ( SOAPsv ) and a de novo short reads assembler ( SOAPdenovo ). And a GPU-accelerated alignment tool (SOAP3/GPU) are being implemented. 使用路徑(http//soap.genomics.org.cn/) |
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