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fanc232新蟲 (小有名氣)
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[求助]
論文上兩幅圖是什么技術(shù)做出來的
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一片文獻里使用到了ChIP reaction技術(shù)，就是把蛋白質(zhì)和DNA復(fù)合物裂解成片段以后，用目的蛋白對應(yīng)的抗體收集復(fù)合物片段，把里面的DNA分離純化出來，PCR擴增，進一步檢測等等，目的是確定目的蛋白結(jié)合在哪一種基因片段上。中間插入了這個圖像，大概意思是展示幾種蛋白質(zhì)結(jié)合在DNA的相似區(qū)域，可是沒有說這是什么做的圖。 我是做生物轉(zhuǎn)計算生物的，不懂這是什么技術(shù)，什么軟件做出來的圖。 圖片在附件里。請各位達人在允許的范圍內(nèi)大概給我指個搜索方向，我真的非常需要知道這是什么圖。先謝謝你們！ [ Last edited by fanc232 on 2011-7-15 at 16:51 ] |
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wanhscn
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【答案】應(yīng)助回帖
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Chip sequence 技術(shù) 圖看得不是太清楚，按照我的經(jīng)驗：圖中橫坐標應(yīng)該是基因的序列位置，縱坐標有峰的位置應(yīng)該是表示為蛋白的結(jié)合位點，峰值的大小表示為統(tǒng)計量，統(tǒng)計Illumina測序的反應(yīng)個數(shù)或者contig條數(shù)，具有一定的概率意義。 推薦讀物：High-Resolution Profiling of Histone Methylations in the Human Genome. Cell 2007 |
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fanc2324樓2011-10-11 11:36:16
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