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wrs213

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[求助] dmol優(yōu)化構(gòu)型時(shí)遇到的報(bào)錯(cuò)，希望高人解答。

Input/Output Error 177: No such file or directory

In Procedure: matget3
      At Line: 97

   Statement: OPEN
         Unit: 64
         File: /local/wangl/d27984/1.tpsmx

Input/Output Error 177: No such file or directory

In Procedure: matget3
      At Line: 97

   Statement: OPEN
         Unit: 64
         File: /local/wangl/d27982/1.tpsmx

Input/Output Error 177: No such file or directory

In Procedure: matget3
      At Line: 97

   Statement: OPEN
         Unit: 64
         File: /local/wangl/d27983/1.tpsmx

End of diagnostics

End of diagnostics

End of diagnostics

MPI Application rank 1 exited before MPI_Finalize() with status 1

** Address Error **
** Address Error **

End of diagnostics

End of diagnostics
.tpsmx文件不是自動(dòng)生成的嗎？為啥會(huì)報(bào)錯(cuò)是沒(méi)有此文件。如果能告訴我計(jì)算中各個(gè)臨時(shí)文件多的作用更是感激不盡。

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1樓 2011-08-09 15:38:59

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★
youzhizhe(金幣+1): 謝謝提示。 2011-08-17 15:20:25

No such file or directory
是不是說(shuō)明沒(méi)有某個(gè)輸入文件？

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2樓2011-08-09 21:26:43

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【答案】應(yīng)助回帖

★
uuv2010(金幣+1): 多謝提示 2011-08-10 13:02:59
wrs213(金幣+1): 有點(diǎn)道理，我再看看問(wèn)問(wèn)服務(wù)器管理員是不是這個(gè)問(wèn)題導(dǎo)致的。 2011-08-10 13:26:09

如有有nfs系統(tǒng)，檢查運(yùn)行節(jié)點(diǎn)上的nfs是否掛上了

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3樓2011-08-10 12:44:49

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引用回帖:

2樓: Originally posted by uuv2010 at 2011-08-09 21:26:43:
No such file or directory
是不是說(shuō)明沒(méi)有某個(gè)輸入文件？

dmol的輸入都有，但是報(bào)錯(cuò)中提到的文件是臨時(shí)文件，是運(yùn)行時(shí)自動(dòng)生成的，運(yùn)行成功結(jié)束后會(huì)自動(dòng)刪除。我不知道這個(gè)臨時(shí)文件為什么會(huì)莫名其妙的不存在了。

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4樓2011-08-10 13:06:29

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
zzy870720z(金幣+2): 謝謝提示 2011-08-10 14:25:10
wrs213(金幣+1): 應(yīng)該不是權(quán)限的問(wèn)題 2011-08-10 18:46:00

可能沒(méi)有權(quán)限寫(xiě)入這個(gè)文件？問(wèn)問(wèn)管理員是不是給你的賬號(hào)設(shè)置在某個(gè)目錄下寫(xiě)臨時(shí)文件的權(quán)限了。

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5樓2011-08-10 13:08:38

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youzhizhe(金幣+1): 謝謝提示。 2011-08-17 15:20:42

把log文件貼出來(lái)看看

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6樓2011-08-10 13:12:40

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6樓: Originally posted by 江山如畫(huà) at 2011-08-10 13:12:40:
把log文件貼出來(lái)看看

ender: LSF System
Subject: Job 561291: <1> Done

Job <1> was submitted from host by user .
Job was executed on host(s) <4*node30>, in queue , as user .
was used as the home directory.
was used as the working directory.
Started at Tue Aug  9 04:43:37 2011
Results reported at Tue Aug  9 16:29:35 2011

Your job looked like:

------------------------------------------------------------
# LSBATCH: User input
./test-4.sh
------------------------------------------------------------

Successfully completed.

Resource usage summary:

CPU time : 168606.77 sec.

The output (if any) follows:
這是貼出來(lái)的log文件報(bào)錯(cuò)信息
Working directory is /home/chem/wangl/methanol/fourlayers/oh/ts2/ch2oh-ch2o/ch2oh-oh-1
Time is Tue Aug 9 04:43:40 CST 2011
This job has allocated 4 nodes
Warning: Licensing environment mpi script not found using default values.
HP-MPI licensed for Accelrys.

Process  # 0  of 4  is working

Process  # 2  of 4  is working

Process  # 1  of 4  is working
Process  # 3  of 4  is working
Checked out license feature: MS_dmol [for 9999:9999:99

ARAD0X__(.)__SUCKERS!] (4 copies)

Checked out license feature: MS_dsolid [for 9999:9999:99

ARAD0X__(.)__SUCKERS!] (4 copies)

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7樓2011-08-10 13:20:49

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5樓: Originally posted by uuv2010 at 2011-08-10 13:08:38:
可能沒(méi)有權(quán)限寫(xiě)入這個(gè)文件？問(wèn)問(wèn)管理員是不是給你的賬號(hào)設(shè)置在某個(gè)目錄下寫(xiě)臨時(shí)文件的權(quán)限了。

交到服務(wù)器上運(yùn)算的作業(yè)有的是可以成功運(yùn)行的，有的是這樣退出的，要是沒(méi)有權(quán)限應(yīng)該是所有交上的作業(yè)都會(huì)運(yùn)行退出吧，應(yīng)該不是權(quán)限的問(wèn)題。

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8樓2011-08-10 13:22:20

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3樓: Originally posted by 江山如畫(huà) at 2011-08-10 12:44:49:
如有有nfs系統(tǒng)，檢查運(yùn)行節(jié)點(diǎn)上的nfs是否掛上了

作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)是LSF，有可能是管理員重啟節(jié)點(diǎn)之類(lèi)的把我的作業(yè)搞掉了吧，但是我想問(wèn)問(wèn)，當(dāng)重啟節(jié)點(diǎn)的話(huà)我正在計(jì)算的作業(yè)會(huì)自動(dòng)退出，那么那些生成的臨時(shí)文件是繼續(xù)存在呢還是自動(dòng)就刪除了呢。我的腳本中，設(shè)置的是臨時(shí)文件在運(yùn)行結(jié)束后自動(dòng)刪除。

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9樓2011-08-10 13:25:20

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★ ★
youzhizhe(金幣+2): 謝謝交流。 2011-08-17 15:20:58
wrs213(金幣+1): 2011-09-05 15:54:52

引用回帖:

9樓: Originally posted by wrs213 at 2011-08-10 13:25:20:
作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)是LSF，有可能是管理員重啟節(jié)點(diǎn)之類(lèi)的把我的作業(yè)搞掉了吧，但是我想問(wèn)問(wèn)，當(dāng)重啟節(jié)點(diǎn)的話(huà)我正在計(jì)算的作業(yè)會(huì)自動(dòng)退出，那么那些生成的臨時(shí)文件是繼續(xù)存在呢還是自動(dòng)就刪除了呢。我的腳本中，設(shè)置的是 ...

腳本沒(méi)執(zhí)行完，自然臨時(shí)文件就在羅。但是正常說(shuō)來(lái)兩次運(yùn)行的臨時(shí)文件名肯定不一樣。我看你這個(gè)情況應(yīng)該是文件系統(tǒng)的問(wèn)題

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10樓2011-08-17 10:50:36

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