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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 量子化學 » Gaussian » 計算平臺提交作業(yè)
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天下楓葉木蟲 (著名寫手)
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[求助]
計算平臺提交作業(yè)
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本人想向?qū)W校計算平臺提交作業(yè)，發(fā)現(xiàn)一次提交一個gjf文件和一個pbs時，平臺給我計算，但是我提交十多個gjf和一個pbs時就提示說找不到見附件，不知道怎么會回事，急啊 |
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wuy069
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【答案】應助回帖
天下楓葉(金幣+1): 謝謝， 2011-08-23 23:41:47
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兩種解決方法： 一：給每個輸入文件配備一個pbs腳本文件；比如，你最開始有1.gjf和1.pbs;現(xiàn)在cp 1.pbs 2.pbs;在2.pbs里把jobname改為2.gjf;依次類推。 二：用批處理的方式處理。其實pbs就是個腳本文件，在里面可以寫環(huán)境變量設置，可以寫命令。把以前用批處理這一套用進來就行。在pbs文件中有一行是提交任務的命令，比如gaussian程序：time g09 < 1.gjf >> 1.log 再在下面起一行： time g09 < 2.gjf >> 2.log 如果還有輸入文件，繼續(xù)下一行：time g09 < 3.gjf >> 3.log 如果你們學校計算平臺沒有限制你們通任務的核數(shù)，用第一種就行；如果pbs管理沒問題的話，限制核數(shù)也用第一種就行，排隊的任務等你前面的任務算完了會接著算。第二種適用于處理一大批單點任務或放長假較好。 |
7樓2011-08-23 16:00:34
2樓2011-08-19 03:49:52
天下楓葉
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3樓2011-08-19 09:40:52
hzfish
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4樓2011-08-19 10:37:42
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