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wqj1988926金蟲 (正式寫手)
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[求助]
我自己利用四個(gè)軟件做的系譜樹圖，我應(yīng)該相信那個(gè)軟件
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我自己利用四個(gè)軟件做的系譜樹圖，所用的序列是一樣的，結(jié)果不一樣，我應(yīng)該相信那個(gè)軟件？ 從上到下依次是我分別采用megalign、mega，phylogeny、clustalw做的圖，各位大俠給個(gè)意見。 |
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wqj1988926
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4樓2011-08-27 08:33:25
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3樓2011-08-26 21:43:53
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
amisking(金幣+3, BioEPI+1): 鼓勵(lì)個(gè)！ 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金幣+2): 2011-08-28 16:59:21
amisking(金幣+3, BioEPI+1): 鼓勵(lì)個(gè)！ 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金幣+2): 2011-08-28 16:59:21
| 個(gè)人認(rèn)為可以使用meta構(gòu)建進(jìn)化樹（論文參考文獻(xiàn)中引用），你可以參考相關(guān)文獻(xiàn)中使用mega構(gòu)建的進(jìn)化樹是怎么論述的，一般是把你得到的基因序列和已知基因序列（文獻(xiàn)中報(bào)道的）一起構(gòu)建進(jìn)化樹，從而比較你的基因與這些已知基因的進(jìn)化關(guān)系；同時(shí)，如果你也可以通過閱讀文獻(xiàn)，查閱已知基因序列中有無一些最保守的氨基酸位點(diǎn)（催化位點(diǎn)、結(jié)合位點(diǎn)等等），在你的基因中是否也同樣存在，如果存在也能證明你的基因的特征。上一步可以生成氨基酸多序列比對的圖，并用*號標(biāo)出這些特征性氨基酸。這樣便可獲得兩組數(shù)據(jù)：構(gòu)建的進(jìn)化樹和氨基酸多序列比對，即形成論文中的兩個(gè)Figure。 |
5樓2011-08-27 14:19:06
cexoihtydx
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6樓2011-08-27 14:20:40
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