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zml2009木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
g09提交不了作業(yè)
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| 我在服務(wù)器上自己的用戶(hù)名下提交作業(yè)，以前一直都可以用G09提交，最近服務(wù)器關(guān)閉了一段時(shí)間重啟后我提交作業(yè)用G03可以，G09反而不行，請(qǐng)問(wèn)這是怎么回事？謝謝高手指點(diǎn)！ |
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zml2009
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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Initial command: /opt/gauss/g03/l1.exe /scratch/Gau-6026.inp -scrdir=/scratch/ Entering Link 1 = /opt/gauss/g03/l1.exe PID= 6027. Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2004, Gaussian, Inc. All Rights Reserved. This is the Gaussian(R) 03 program. It is based on the the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.), the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.), the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.), the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.), the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.), the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983, Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered trademark of Gaussian, Inc. This software contains proprietary and confidential information, including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc. This software is provided under written license and may be used, copied, transmitted, or stored only in accord with that written license. The following legend is applicable only to US Government contracts under FAR: RESTRICTED RIGHTS LEGEND Use, reproduction and disclosure by the US Government is subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a) and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted Rights clause in FAR 52.227-19. Gaussian, Inc. "4x5-t-hse.log" 96L, 4381C 1,2 Top Gaussian 03, Revision D.01, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004. ****************************************** Gaussian 03: AM64L-G03RevD.01 13-Oct-2005 29-Aug-2011 ****************************************** %chk=/home/guoyong3/graphse/ct/4x5-t-hse.chk %mem=3000mb %nproc=8 Will use up to 8 processors via shared memory. ---------------------------------- # opt=noeigen uhseh1pbe/6-31g(d,p) ---------------------------------- QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE. # opt=noeigen uhseh1pbe/6-31g(d,p) ' Last state="GCL" TCursr= 909 LCursr= 14 Error termination via Lnk1e in /opt/gauss/g03/l1.exe at Mon Aug 29 17:12:38 2011. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 5.4 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 8 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 這就是用不到G09，而是用G03來(lái)計(jì)算，G03算不了HSE，所以提示錯(cuò)誤，我使用G09提交的，如前所述，以前都可以用G09算的，服務(wù)器重啟后有好多節(jié)點(diǎn)都關(guān)閉了，只開(kāi)了出部分幾個(gè)來(lái)供大家計(jì)算，現(xiàn)在用G03可以算，G09反而不行 |
3樓2011-08-29 20:31:08
2樓2011-08-29 20:19:52
superfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
zml2009(金幣+2): 2011-08-30 08:44:20
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很明顯是調(diào)用G03算的，而不是G09，查看一下調(diào)用的G09是否存在， [afea@console Ion]$ which g09 ~/soft/gauss/g09/g09 如果是g09 xx.com&提交 看看.bashrc（假設(shè)你是用的bshell）是不是g09 export g09root=~/soft/gauss . $g09root/g09/bsd/g09.profile 如果同時(shí)有G03和G09的定義，封上g03的（句前加#），否則有可能會(huì)是g03 腳本pbs，或者sge腳本提交，似乎不該出現(xiàn)這樣問(wèn)題！ |
4樓2011-08-29 21:05:06
zml2009
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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5樓2011-08-30 08:54:00
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