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liuxiu841027

金蟲(chóng) (正式寫手)

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[交流] 有關(guān)DS的問(wèn)題

想請(qǐng)教一個(gè)問(wèn)題：我用DS的libdock對(duì)接篩選了一個(gè)化合物庫(kù)，結(jié)果出來(lái)很多分子，怎么樣把這些化合物分子導(dǎo)出來(lái)到Chemdraw成2D結(jié)構(gòu)呢？謝謝！

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1樓 2011-08-31 15:07:08

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liuxiu841027

金蟲(chóng) (正式寫手)

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2樓: Originally posted by ts2009 at 2011-08-31 20:54:55:
可以用某些軟件把這些分子轉(zhuǎn)換成2D的，沒(méi)必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常見(jiàn)的格式如sdf 之類的。

轉(zhuǎn)成2D的能很清楚的像chemdraw看到的結(jié)果一樣嗎？有想能清楚地看到結(jié)構(gòu)，就像chemdraw畫圖顯示的結(jié)果一樣呢，可以復(fù)制到word或ppt中的

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3樓2011-09-01 11:50:07

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ts2009

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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-08-31 22:39:59
liuxiu841027(金幣+1): 謝謝 2011-09-01 11:48:02

可以用某些軟件把這些分子轉(zhuǎn)換成2D的，沒(méi)必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常見(jiàn)的格式如sdf 之類的。

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2樓2011-08-31 20:54:55

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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-09-01 15:34:17

我剛才找了下，用軟件轉(zhuǎn)成的2D結(jié)構(gòu)不能保存成png,tif或是jpg格式的圖像文件。所以個(gè)人覺(jué)得可以用軟件轉(zhuǎn)換成2D結(jié)構(gòu)后，用chemica draw 重新畫，這樣能保證分辨率，對(duì)于發(fā)paper很重要。提醒的是必須先轉(zhuǎn)換成2D結(jié)構(gòu)，不然由于3D圖像分子中的手性以及二面角的影響，是無(wú)法直觀的用3D圖像畫出2D的圖像的。祝好運(yùn)。。。

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4樓2011-09-01 13:14:54

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4樓: Originally posted by ts2009 at 2011-09-01 13:14:54:
我剛才找了下，用軟件轉(zhuǎn)成的2D結(jié)構(gòu)不能保存成png,tif或是jpg格式的圖像文件。所以個(gè)人覺(jué)得可以用軟件轉(zhuǎn)換成2D結(jié)構(gòu)后，用chemica draw 重新畫，這樣能保證分辨率，對(duì)于發(fā)paper很重要。提醒的是必須先轉(zhuǎn)換成2D結(jié)構(gòu)， ...

恩，謝謝！我用DS保存成mol2格式，再在chem3D打開(kāi)可以用chemdraw顯示2D結(jié)構(gòu)。但是只能一個(gè)一個(gè)的，太慢了，想快點(diǎn)，多個(gè)或批量的導(dǎo)出

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5樓2011-09-01 15:24:05

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