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wgcsteel木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
各位朋友,初學(xué)者迷茫問(wèn)一個(gè)簡(jiǎn)單問(wèn)題
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| 用分子動(dòng)力學(xué)模擬時(shí),由于計(jì)算能力的限制,通常設(shè)置周期性邊界條件,這對(duì)模擬宏觀尺寸材料性質(zhì)可以理解,但對(duì)模擬納米尺寸材料也要有周期性邊界條件嗎,還是根據(jù)研究對(duì)象的大小來(lái)確定要不要設(shè),比如尺寸細(xì)小到用一個(gè)模擬單元即可時(shí),就不用設(shè)周期性邊界條件?另外,這樣得出來(lái)的性質(zhì)會(huì)隨單元數(shù)量(對(duì)象的尺寸)不同而不同嗎? |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
| 如果模擬的是團(tuán)簇,它本身就不是周期性的,當(dāng)然不能用周期性邊界條件。但是把模擬的盒子的尺寸取大一點(diǎn),讓盒子與盒子中的原子沒(méi)有相互作用也是一種做法。模擬的性質(zhì)一般要求不會(huì)隨著你所選尺寸的大小而變化,否則就說(shuō)明你的模擬有問(wèn)題。所選盒子的大小應(yīng)該大于兩倍的截?cái)喟霃剑@個(gè)在一般的書(shū)上都會(huì)講到。 |
| 如果你搭建的盒子沒(méi)有10nm,即原子都是滿滿占據(jù)在盒子里面,恰好用的又是周期性邊界條件,那么你算的體系被認(rèn)為是塊體的性質(zhì)。如果你想模擬10nm的顆粒的話,所謂顆粒就是外面含有自由的表面,要么不要周期性邊界條件,要么取一個(gè)超大的盒子,比如100nm,而把你想模擬的原子放在盒子中央,此時(shí)就算是周期性邊界條件也沒(méi)有關(guān)系。 |
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