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金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能

[求助] 如何把Psf文件由NAMD的Xplor轉(zhuǎn)換成Charmm格式

各位同學(xué)，老師：
我想把NAMD的xplor格式的psf變成CHARMM格式的。聽說用VMD的psfgen可以實(shí)現(xiàn),把psf,pdb讀進(jìn)去后，然后writepsf charmm xxx.psf,我運(yùn)行后，產(chǎn)生的CHARMM格式的文件,charmm仍然讀不了，很奇怪，請(qǐng)問，還有什么其他方法能把NAMD的XPLOR格式的PSF轉(zhuǎn)變成正確的CHARMM格式，謝謝各位！

PS：我的namd的psf文件已經(jīng)和我的dcd匹配了，只需要格式轉(zhuǎn)換，不需要?jiǎng)e的修改，any help will be appreciate!

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1樓 2011-09-02 15:16:37

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