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放線菌分子生物學鑒定
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我提取的放線菌總DNA用通用引物擴增目的序列,測序結(jié)果如下: 您的PCR樣品 (2) (使用27F/1492R 引物 )測序后發(fā)現(xiàn)有重疊現(xiàn)象,我們懷疑是由以下幾個方面的原因造成的: 1.已純化的PCR樣品造成這種情況的原因是由于模板純化有一定問題,模板中含有非特異性的條帶; 2.如果是未純化的PCR產(chǎn)物,那么有可能是您要求測序的片段周圍含有大小相近的條帶,我們通過瓊脂糖凝膠回收,無法有效切除這種大小差別不是很明顯的條帶; 3.模板或是引物質(zhì)量較差,測序反應結(jié)束之后沒有產(chǎn)生足夠的目的產(chǎn)物,導致測序信號較弱,雜背景較高,形成重疊現(xiàn)象。 這些原因都可能造成PCR樣品測序之后出現(xiàn)重疊現(xiàn)象.建議您改進后重新進行測序。 以上是測序公司的反饋,該怎么解決這些問題呢,謝謝大家。 |


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