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hbfxxj銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
基因注釋證據(jù)整合軟件
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| 不知道基因注釋用什么整合軟件比較好。glean除外。謝謝了�。。。。。。。�！ |
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hbfxxj
銅蟲 (初入文壇)
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3樓2011-09-07 17:37:26
yangsh_nj
木蟲 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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amisking(金幣+2): 鼓勵(lì)發(fā)帖交流。 2011-09-07 18:10:50
amisking(金幣+2): 鼓勵(lì)發(fā)帖交流。 2011-09-07 18:10:50
| 不知道你所需要的gene annotation指的到底是什么。基因組或獲得片段基因的預(yù)測(cè)？這個(gè)用FgeneSH (www.softberry.com)還不錯(cuò)，至少比genescan什么的要靠譜些。如果是已知基因片段，想知道類似基因的功能，可采用blast的方法去搜索已知功能基因的annotation。也可以通過(guò)GO分析大致知道其基本生物學(xué)分類，或pfam知道其已知的結(jié)構(gòu)域，然后做一定的功能推測(cè)。 |
2樓2011-09-07 15:35:31
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