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robertorun金蟲 (正式寫手)
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[求助]
求2011國基金摘要31172252
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求助摘要的編號: 31172252 項目名稱: 苜蓿共生結(jié)瘤體系響應重金屬銅脅迫的轉(zhuǎn)錄組研究 項目類型: 面上項目 [ Last edited by robertorun on 2011-9-14 at 10:52 ] |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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苜蓿共生結(jié)瘤體系響應重金屬銅脅迫的轉(zhuǎn)錄組研究 負責人:丑敏霞 參與人:丑敏霞, 李哲斐, 傅晶, 史鵬, 梁建強, 姜小倩, 柳思思 金額:62萬 申請時間:2011 學科代碼:草種質(zhì)資源與育種(C170202) 項目批準號:31172252 申請單位:西北農(nóng)林科技大學 摘要:以具有西部地域特征的、重金屬抗性的天藍苜蓿(Medicago lupulina L.)―-苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti CCNWSX0020)共生固氮體系為模式,應用最新發(fā)展起來的RNA-Seq 技術(shù)分別對銅離子脅迫和非脅迫條件下接種根瘤菌后天藍苜蓿根組織中的轉(zhuǎn)錄本測序,通過與苜蓿全基因組的比較,分析天藍苜蓿共生結(jié)瘤體系在銅離子脅迫和非脅迫兩種生長條件下相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄表達水平及基因轉(zhuǎn)錄體的結(jié)構(gòu),尋找新轉(zhuǎn)錄本和新外顯子;分析基因轉(zhuǎn)錄體的可變剪接種類和數(shù)量并通過qPCR驗證,推測天藍苜蓿中可變剪接的可能發(fā)生機制;分析兩種培養(yǎng)條件下的差異表達基因并進行GO功能富集分析和KEGG代謝途徑分析,從而于轉(zhuǎn)錄組水平上系統(tǒng)研究銅離子影響天藍苜蓿與根瘤菌共生互作的分子機理,為重金屬脅迫下豆科植物共生互作機制的最終闡明奠定基礎(chǔ)。 |
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