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springimu木蟲 (著名寫手)
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[交流]
蜥蜴全基因組測序完成
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綠色變色龍蜥蜴是一種靈巧活潑的生物,這全憑其基因組所賜。蜥蜴全基因組測序使這種遺傳性靈巧和其他新的線索浮現(xiàn)出來,并為人類、哺乳動物及相同進化級別爬蟲類生物的基因組如何進化提供了見解,因為哺乳動物和爬蟲生物是在3.2億年前開始分化的。完成這項測序工程的研究人員8月31號在《 Nature》在線發(fā)表了他們的成果。 綠色變色龍蜥蜴(Anolis carolinensis)是第一種完成全基因組測序和組裝的非鳥類爬行動物。研究人員組裝并分析了超過20中哺乳動物的基因組,包括那些人類的進化史近親,但是爬行動物的遺傳圖譜卻一直未完成。 蜥蜴相比其他基因組已被測序的生物來說與同為爬行動物的鳥類更為接近。就像哺乳動物一樣,鳥類和蜥蜴都是脊椎動物,這意味著他們都可以在水中產(chǎn)卵。“人們已經(jīng)對脊椎動物進化樹不同部分的動物進行了測序,但是之前還沒有對蜥蜴進行取樣研究,”《Nature》雜志的脊椎動物生物學(xué)科學(xué)主編Kerstin Lindblad-Toh說,“這是一個非常重要的分支! 在加勒比海、北美、中美及南美分散著超過400種蜥蜴,這使得它們成為一種很好的研究進化的模式生物。盡管有關(guān)蜥蜴的生物學(xué)及行為學(xué)已經(jīng)所知頗多,但是遺傳學(xué)信息對于了解蜥蜴在進化中是如何分化十分重要。 最新測序的基因組可能幫忙解決在人類基因組織中與保守起源有關(guān)的非編碼因子問題。這些區(qū)域不包含蛋白質(zhì)編碼基因,但是被認為具有非常重要的作用,因為它們在哺乳動物中一直都沒有變化?茖W(xué)家很好奇這些神秘 因子的來源,推測它們可能是殘余的轉(zhuǎn)座子。在人類中,很多這種叫做“跳躍基因”的基因已經(jīng)失去了跳躍的能力,但是在蜥蜴中這種能力還保留著。 研究者將這些移動因子與人類基因組進行了對比,發(fā)現(xiàn)有將近100個人類基因組非編碼基因是來自于這些跳躍基因。 研究人員首次分析了變色龍基因組中其他幾種獨特特征,包括微染色體,這是一種在爬行動物、兩棲動物及魚類中常發(fā)現(xiàn)的小染色體,但是從未出現(xiàn)在哺乳動物中。他們還發(fā)現(xiàn)了等容線的完全缺失,等容線是具有高濃度或低濃度鳥嘌呤或胸腺嘧啶的基因組區(qū)域,使人類染色體呈獨特的帶型。 此外,研究小組發(fā)現(xiàn)了蜥蜴的性染色體,這在以前的研究中只是一個猜想推測的對象。跟哺乳動物一樣,綠色變色龍也有XX和XY染色體,這與鳥類不一樣,雄性鳥類的性染色體為ZZ,雌性為ZW。蜥蜴的X性染色體是其眾多微染色體中的一條。 |

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