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微笑不彷徨銀蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
軟件使用問(wèn)題 已有1人參與
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各位分子生物學(xué)領(lǐng)域的大蝦們，可否能給予幫助？ 我的研究方向是動(dòng)物線(xiàn)粒體基因組，目前處于數(shù)據(jù)處理階段，問(wèn)題重重，小女子在此懇求各位大蝦們慷慨解囊，知識(shí)共享！ 在對(duì)線(xiàn)粒體編碼基因用Clustal比對(duì)后，再進(jìn)行人工校對(duì)，以確保在翻譯成氨基酸之前，比對(duì)序列中的空格前的密碼子能被3整除，然后翻譯成氨基酸，空格不變，再用MEGA或SeqVerter軟件將fasta或gb格式轉(zhuǎn)換成phylip或nexus格式，一切就緒之后，用ProtTest2.4計(jì)算氨基酸的最適模型，窗口提示：ProtTest encounted some error. Check the error message in the console. 界面上的說(shuō)明如下： java.io.IOException: Cannot run program "D:/program/%e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6/prottest2.4/ProtTest2.4/bin/phyml-prottest-windows.exe": CreateProcess error=3, ??????? Most errors are related to alignment format problems. Check your alignment, please. In Windows errors are sometimes related to filenames and file-paths conflicts In order to circumvent those conflicts place your input files in a lower-level directory (e.g. C） 懇請(qǐng)高手給予指點(diǎn)，不甚感激！ |
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scyxk
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
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- 在線(xiàn): 11小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1286600
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- 專(zhuān)業(yè): 動(dòng)物系統(tǒng)及分類(lèi)學(xué)
2樓2011-11-04 19:11:04
西瓜
榮譽(yù)版主 (知名作家)
- MolEPI: 50
- 應(yīng)助: 94 (初中生)
- 貴賓: 3.157
- 金幣: 1849.6
- 散金: 11458
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- 沙發(fā): 21
- 帖子: 7553
- 在線(xiàn): 1449.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 271749
- 注冊(cè): 2006-08-13
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 細(xì)胞衰老
- 管轄: 分子生物
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不是很清楚，不過(guò)我對(duì)"D:/program/%e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6/“這個(gè)路徑有點(diǎn)懷疑。e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6這個(gè)文件夾的名字是中文的嗎？國(guó)外的軟件有的在中文名的文件夾下是不能用的，或者太長(zhǎng)的文件夾名字也不行。當(dāng)然，如果你這軟件能用，只是這次出問(wèn)題，那可以排除這種情況。 如果是剛用就出現(xiàn)問(wèn)題，可以試試把軟件卸載了，再重新安裝在英文名的文件夾里（路徑上的所有文件夾都用英文名）。 Good luck！ |
3樓2011-11-04 23:46:39
4樓2018-05-18 17:28:22
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