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[求助]
用discover模塊做吸附時(shí)
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| 吸附質(zhì)和吸附表面的大小怎么樣確定，就是怎樣設(shè)定二的大小使其匹配，還有要在水溶液當(dāng)中進(jìn)行吸附模擬的話怎樣加水盒子，，，急�。。�！求知道的大俠指點(diǎn)啊�。�！ |
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薔薇妮妮
新蟲 (初入文壇)
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你好，菜鳥求助。請(qǐng)問(wèn)鐵的能量參數(shù)尺度參數(shù)是多少，在哪可以查？盒子尺寸根據(jù)什么確定的呢，還望大神不吝賜教，先謝過(guò)了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2016-10-18 08:15:31
gyldmy
銅蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
uuv2010(金幣+3): 多謝提示 2011-10-05 16:59:08
uuv2010(金幣+3): 多謝提示 2011-10-05 16:59:08
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我也是剛剛開始接觸MD，大家互相學(xué)習(xí)，關(guān)于你提出的問(wèn)題，我說(shuō)一下自己的見解，首先你應(yīng)該確定你吸附表面的大小，不知道你的吸附材料是什么，我用的是Fe，首先就是切面，超晶胞（這一步確定你的吸附表面的大小，你可以用build-symmetry-Lattice parameters查看，其中a和b的數(shù)值就是你表面的大小）。 而吸附質(zhì)與吸附表面的大小匹配要借助水盒子來(lái)完成，你要用Modules-AmorphousCell-Construction來(lái)建立一個(gè)含有若干水分子和吸附質(zhì)的盒子，然后在對(duì)話框中找到Cell parameters（Angstrom）選擇Specify a，b，改變a，b的數(shù)值使之與之前的吸附表面的a，b的數(shù)值相匹配。 |
2樓2011-10-04 16:07:44
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