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taizifeihong新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于同源建模預(yù)測(cè)蛋白三維結(jié)構(gòu)
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MTKVYPKVSEEYTLNIERARRKLRGLIAEKNCAPIILRLAWHASGTYDQESKTGGPLGTIRFGQELAHTANAGLEIAVNLLQPIKEKYPDLSYADFYTLAGVVAVEVTGGPTIPFHPGRKDHETVPVEGRLPDATKGMDHLRCVFTKQMGLTDKDIVTLSGAHTLGRCHKDRSGFEGAWTPNPLQFDNTYFKVLLEGEKDGLIMLPSDKALLGDPNTRALVELYAKDEDKFFEDYAESHLKLSELGFAEAGQPGSV 哪位高人幫下忙，看能不能預(yù)測(cè)該蛋白的三維結(jié)構(gòu)，想知道具體的結(jié)構(gòu)描述。 同時(shí)請(qǐng)教是如何預(yù)測(cè)的？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
西瓜(金幣+2): good 2011-10-03 23:53:37
西瓜(金幣+2): good 2011-10-03 23:53:37
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你可以看看 http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 說(shuō)不定你的蛋白晶體結(jié)構(gòu)早就解出來(lái)了 |
2樓2011-10-02 15:33:09
【答案】應(yīng)助回帖
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我大概看了一下你的序列 是Vc過(guò)氧化物酶嗎？如果是的話 3級(jí)結(jié)構(gòu)你可以去 http://www.rcsb.org/pdb/results/ ... p;tabtoshow=Current 不是的話 應(yīng)該也差不多 |
3樓2011-10-02 15:39:15
taizifeihong
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 5.5
- 帖子: 3
- 在線: 1.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 314423
- 注冊(cè): 2007-02-25
- 性別: MM
- 專業(yè): 園藝
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下面這段話是別人文章當(dāng)中的，我就是想知道我要如何寫我的序列，這些分析從哪來(lái)？ “如圖3所示, GbMnSOD蛋白質(zhì)包含12個(gè)α螺旋, 3個(gè)β折疊片, 12個(gè)卷曲和10個(gè)轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)。該蛋白結(jié)構(gòu)的N端區(qū)主要是兩個(gè)長(zhǎng)的反平行螺旋構(gòu)成, C端區(qū)主要為1個(gè)擰成三股β折疊片的超二級(jí)結(jié)構(gòu)。在活性部位,以Mn原子為中心形成1個(gè)五配位的三角雙錐構(gòu)型,其中1個(gè)軸向位置為水分子,其他4個(gè)配位基為3個(gè)His和1個(gè)Asp。在這4個(gè)氨基酸中,有兩個(gè)His (96、190位)和186位的Asp配位基位于赤道面,而51位的His的咪唑基則占據(jù)另一個(gè)軸向位置,與水分子對(duì)稱。該預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)中,活性中心處于一個(gè)主要由疏水性氨基酸殘基構(gòu)成的籃子里�！� |
4樓2011-10-02 15:54:26
5樓2011-10-02 16:22:22
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