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guolianshun銅蟲 (著名寫手)
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[求助]
請看這個(gè)電子密度圖是如何做的呀？
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請知道的指教，如果能幫助本人能得到類似的圖，金幣還會(huì)追加。謝謝。見下圖： |
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 第一原理資料匯編 | VASP |
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acridine
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★ ★
賀儀(金幣+2): 多謝指教！ 2011-10-19 10:18:39
賀儀(金幣+2): 多謝指教！ 2011-10-19 10:18:39
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繪圖軟件中應(yīng)該有增加等高線數(shù)目的選項(xiàng)吧。 另外這個(gè)現(xiàn)象同樣也有可能是結(jié)果文件的網(wǎng)格點(diǎn)密度不足造成的 想得到密集的等高線，你的電荷密度結(jié)果文件中的網(wǎng)格點(diǎn)也要非常密。 可以從目前得到的等高線圖大概估計(jì)一下，圖總最密的等高線之間的距離是多少，如果已經(jīng)達(dá)到了電荷密度數(shù)據(jù)點(diǎn)的間距，那就表明此時(shí)等高線已經(jīng)不可能再密了（相鄰等高線之間已經(jīng)沒有數(shù)據(jù)點(diǎn)），想得到更密的圖像只有寄希望于增加數(shù)據(jù)。 |
7樓2011-10-18 23:02:26
acridine
木蟲 (正式寫手)
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賀儀(金幣+5): 多謝提示！ 2011-10-17 21:40:42
賀儀(金幣+5): 多謝提示！ 2011-10-17 21:40:42
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這個(gè)問題也是屬于一直被提起，從未被牢記的問題了～ 版內(nèi)搜索"電荷密度圖"，能找到很多座樓的，雖然很多是懸而未決的“爛尾樓”，但基本的幾種方法還是能夠了解到的。 比如上面提到的lev00軟件就是一種方法，個(gè)人認(rèn)為是比較完美的解決方案，但是linux下的程序。 再就是直接從得到的電荷密度文件中提取所需面內(nèi)的電荷數(shù)據(jù)，之后用origin或matlab等軟件畫等高線圖。缺點(diǎn)是只能處理比較簡單的面，比如水平面、豎直面。如果要畫其他更一般的切面，則需要編程序來提取面內(nèi)的電荷數(shù)據(jù)。 但無論直接提取還是編程提取，都需要電荷密度文件是可讀懂的，否則（比如castep得到的差分電荷的數(shù)據(jù)）就無法用此類方法解決，據(jù)我所知只能考慮lev00。 當(dāng)然，也不必要過于完美主義。其實(shí)我就覺得MS自帶的切面圖也蠻不錯(cuò)的，用來說明問題也足夠了。過于糾結(jié)與圖的細(xì)節(jié)反倒是沒有必要。 |
3樓2011-10-17 21:37:53
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4樓2011-10-18 08:54:49
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