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ydxia鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)教關(guān)于materials studio建模和OPLS力場(chǎng)
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我打算用Lammps做一些MD模擬，用materials studio建好分子鏈后，點(diǎn)擊cvff力場(chǎng)，MS就會(huì)自動(dòng)為分子鏈分配勢(shì)能函數(shù)，很方便。但是，我想重復(fù)一下別人的文獻(xiàn)結(jié)果，他們用的是OPLS力場(chǎng)，這個(gè)力場(chǎng)在MS里面是沒(méi)有的，請(qǐng)問(wèn)我該怎么辦呢？先查好相關(guān)的力場(chǎng)參數(shù)，然后手動(dòng)輸入到data file里面嗎？但問(wèn)題的關(guān)鍵是，我比較了一下cvff和文獻(xiàn)中的OPLS對(duì)這條分子鏈的處理，比如atom type，發(fā)現(xiàn)OPLS區(qū)分得更細(xì)致，atom type的個(gè)數(shù)多，而cvff區(qū)分得則比較粗，atom type的個(gè)數(shù)少，還有像二面角之類(lèi)的....還有人說(shuō)需要我自己手動(dòng)把OPLS的力場(chǎng)加入到MS中，但是這個(gè)過(guò)程貌似很復(fù)雜的樣子.... 歸結(jié)一下我的問(wèn)題： 在MS建模的前提下，如何使用OPLS力場(chǎng)？具體過(guò)程是怎么的呢？ 謝謝！ [ Last edited by ydxia on 2011-10-21 at 05:20 ] |
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5樓2011-10-21 21:16:47
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