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小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » 急！請問改圖是如何做出來的？
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[求助]
急！請問改圖是如何做出來的？
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請問附件里的圖是如何做出來的? 即：在骨架上能用不同顏色標示單個氨基酸，并用綠色圓暈顯示出來，N和C端用圓點標示。 謝謝！  |
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loudonghua
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【答案】應(yīng)助回帖
bioqu(金幣+10): 謝謝！就是那個綠色圓暈的顏色沒有PDF中的濃，不是很明顯。再送你朵紅花，謝謝！ 2011-10-28 20:11:56
御劍江湖(模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-29 09:55:53
御劍江湖(模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-29 09:55:53
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可以利用VMD做出來，具體過程如下： 現(xiàn)在VMD中載入你的蛋白質(zhì)分子，在VMDmain選擇Graphics-->Graphiccal Representations，打開對話框之后，在selected atoms中選all在Drawing style 中coloring Method 選colorID 7,drawing method 選lines；點擊create Rep，在select atoms用命令resid 氨基酸序號 and name C或者N段原子名稱，然后再在Drawing style 中coloring Method 選colorID 選所需要的顏色 ,drawing method 選VDW；點擊create Rep，在select atoms用命令Resname 氨基酸名字如RLN，然后再在Drawing style 中coloring Method 選colorID 選所需要的顏色 ,drawing method 選所需要的表示法； ； |
2樓2011-10-28 11:08:53
loudonghua
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3樓2011-10-29 09:25:18
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