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釀酒酵母基因組PCR出了16S的條帶 已有1人參與
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| 實(shí)驗(yàn)要用釀酒酵母的基因組全測(cè)序。但是在華大16S檢測(cè)排除細(xì)菌污染的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)能P出16S的條帶。隨后我自己重新劃線分離單菌落，重提了基因組DNA，用16S通用引物PCR發(fā)現(xiàn)還是有16S的條帶出現(xiàn)，請(qǐng)各位大俠給予解釋~ |
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 微生物 釀酒 酵母 乳酸菌 飲料 |
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scelab
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不懂~~~
2樓2011-10-31 13:41:38
，你批不出來才怪了 哥哥。呵呵。你們控制好條件了沒有。譬喻說提取過程�？諝庵械募�(xì)菌，以及加樣過程。難道沒有可能染菌。提取的試劑還有其他的。這個(gè)過程很嚴(yán)格。。。。。預(yù)祝你搞好。對(duì)于基因組哥不了解 3樓2011-10-31 14:17:22
4樓2011-10-31 15:55:51
girlfisher
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8樓2014-05-16 15:58:36
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【答案】應(yīng)助回帖
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首先，你的釀酒酵母是不是真正的純培養(yǎng)，既然要做重測(cè)序，那么有可能你的菌株在分離的時(shí)候就沒有得到純培養(yǎng)，這個(gè)非常常見。 所以，將你的培養(yǎng)物在酵母選擇性培養(yǎng)基中再次劃線培養(yǎng)，可能的話，加入一點(diǎn)兒抗生素來做。多劃線幾次。 最后，為了確定污染的情況，你可以做一個(gè)細(xì)菌16S 的qPCR,即拷貝數(shù)檢測(cè)，看看是不是會(huì)影響你的全基因組測(cè)序。 公司提出的問題實(shí)際上比較重要，如果你的細(xì)菌污染比例很大，后期分析會(huì)非常非常麻煩。 |
9樓2014-05-16 22:28:36
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