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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 材料區(qū) » 晶體 » 晶體解析 » 求助：編輯的問題
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ssdyok木蟲 (著名寫手)
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[求助]
求助：編輯的問題
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問題1 - Please recheck the positions of H1 and H2. I think that H1 is not well placed. Delete the two from the atom list. Do some cycles of refinements and plave H1 and H2 with help of the difference Fourier map. Then place the protons with: O1 6 0.532025 0.642637 0.206021 11.00000 0.05265 0.02086 = 0.06080 0.00192 0.01990 -0.00491 AFIX 2 H1 2 x y z 11.00000 -1.20000 AFIX 0 O2 6 0.432008 0.292037 0.154513 11.00000 0.05390 0.02536 = 0.05214 -0.01416 0.01485 -0.00338 AFIX 2 H3 2 x y z 11.00000 -1.20000 AFIX 0 where x y z are the positions from the Difference Fourier. For the oxygen atoms use the positions to which the proton is the closest. 問題2 - please check these points; maybe you should remove the protons and try to locate them by Fourier difference maps PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C2 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C4 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C6 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C8 問題1和2應該是一樣的解決方式吧？從Fourier difference maps中找出H，然后用編輯的方法命名？但如何看Fourier difference maps�。吭趺磸睦锩嬲襀？命名后還需要refine嗎？？求具體的步驟，謝謝啦！ 問題3 -Insert _iucr_refine_instructions_details (=the last .res-file) in the cif-file. This is not mandatory, but highly recommended 讓我把res復制進來嗎？在哪段輸入？格式是怎么樣的？ 問題4 - Give the hall symbol 完全不明白什么意思 真誠請求各位高手的幫助！ |
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6樓2011-11-18 12:07:37
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謝謝xi老師的回復 大概是因為有個這四個G錯誤，編輯讓從新傅里葉加氫，這四個都是甲基 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C2 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C4 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C6 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C8 謝謝指點，checkcif看到了 Space group P 21/c Hall group -P 2ybc |
7樓2011-11-18 12:50:23
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8樓2011-11-18 15:58:20
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