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nnipp金蟲 (小有名氣)
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求.XYZ 文件獲得任意原子距離工具
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剛開始學(xué)習(xí)分子動(dòng)力學(xué) 如何從.XYZ 文件獲得任意原子距離 各位大俠有現(xiàn)成的小工具嗎？ 悲催，不會(huì)編程=。=“ |
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2樓2011-11-16 13:25:00
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4樓2011-11-17 09:00:32
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5樓2011-11-17 21:38:28
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6樓2011-11-18 06:36:12
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7樓2011-11-18 23:25:18
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-11-19 11:27:48
nnipp(金幣+10): 謝謝 用什么命令可以讀取每一步坐標(biāo) 并計(jì)算指定某兩個(gè)原子每一步的距離呢 2011-11-20 18:11:58
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-11-19 11:27:48
nnipp(金幣+10): 謝謝 用什么命令可以讀取每一步坐標(biāo) 并計(jì)算指定某兩個(gè)原子每一步的距離呢 2011-11-20 18:11:58
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用fortran 很簡(jiǎn)單的編程， 就是先把 xyz 文件讀入, 例如有兩個(gè)原子坐標(biāo)分別為（x1, y1, z1）和 (x2, y2, z2) 用d = sqrt ( （x1- x2）**2 + (y1-y2)**2 + (z1-z2)**2 )，也就是數(shù)學(xué)上計(jì)算三維空間上兩個(gè) 點(diǎn)之間的距離 ：sqrt 是根號(hào)的意思。 |
8樓2011-11-19 08:52:57
nnipp
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9樓2011-11-20 18:06:40
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nnipp10樓2011-11-20 22:29:52
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