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[交流] 關(guān)于基因組選擇育種問(wèn)題

請(qǐng)高手指點(diǎn)下，要做基因組選擇育種，目前已經(jīng)完成了全基因組測(cè)序，那么下面該干什么工作呢？

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1樓 2011-11-19 21:25:08

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wanhscn

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lengfeng0210(金幣+1): 2011-11-20 11:07:48

測(cè)序的序列全部組裝完了嗎？
如果沒(méi)有組裝，還得把它拼起來(lái)！

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2樓2011-11-19 22:06:20

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禮儀仁智信

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同樣的問(wèn)題……

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3樓2011-11-19 22:24:24

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xuyuhuicai

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lengfeng0210(金幣+1): 2011-11-20 11:08:04

找到和相關(guān)優(yōu)良性狀緊密連鎖的SNPs，然后進(jìn)行MAS。（動(dòng)物也這樣？）

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4樓2011-11-19 22:29:03

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lengfeng0210

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2樓: Originally posted by wanhscn at 2011-11-19 22:06:20:
測(cè)序的序列全部組裝完了嗎？
如果沒(méi)有組裝，還得把它拼起來(lái)！

已經(jīng)拼接好，并繪制成了圖譜，下一步是否就是如四樓所說(shuō)，尋找想要的snp呢？

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5樓2011-11-20 11:07:09

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syjun2003

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不一樣吧，你還是讀讀文獻(xiàn)，基因組選擇育種英文應(yīng)該genomic selection，mas是分子輔助育種，主要是QTL定位和關(guān)聯(lián)分析，所以應(yīng)該是不一樣的。我覺(jué)得這樣的問(wèn)題應(yīng)該自己去讀論文，看書(shū)，而不是來(lái)小木蟲(chóng)。自己連概念都不清楚，問(wèn)出來(lái)也沒(méi)意思。

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6樓2011-11-20 12:11:02

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wanhscn

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引用回帖:

5樓: Originally posted by lengfeng0210 at 2011-11-20 11:07:09:
已經(jīng)拼接好，并繪制成了圖譜，下一步是否就是如四樓所說(shuō)，尋找想要的snp呢？

下一步,就是尋找與育種性狀相關(guān)的基因組區(qū)域以及基因,并進(jìn)行功能的驗(yàn)證.
然后可以在種質(zhì)資源中尋找優(yōu)異的基因,然后利用育種方法配合分子標(biāo)記選擇,設(shè)計(jì)并優(yōu)化這些與育種相關(guān)的基因組區(qū)域.
目前主要的任務(wù)還是要準(zhǔn)確的尋找育種相關(guān)的基因組區(qū)域以及基因!設(shè)計(jì)育種時(shí)間還長(zhǎng).
尋找育種相關(guān)的基因組區(qū)域有以下方法:QTL分析,關(guān)聯(lián)分析,選擇區(qū)域的掃描分析,或者生物信息學(xué)分析基因功能并轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證!

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7樓2011-11-20 12:59:46

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changwa

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我也正在學(xué)習(xí)呢

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8樓2011-11-20 18:43:32

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wandou399

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找出有利基因進(jìn)行克隆或分析。

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9樓2011-11-21 08:43:59

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