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zhongyunxia新蟲 (小有名氣)
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[求助]
mdrun出錯(cuò)，求幫助
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各位，我的mdrun報(bào)錯(cuò) 是這樣的：waring:1-4interaction between 1936 and1939 at distance 4.425 which is larger than the 1-4 table size 2 .4nm these are ignored for the rest of the simulation.this usually means your systerm is exploding,if not ,you should increase table-extension in your mdp file or with user tables increase the table size 我的mdp文件中dt已經(jīng)設(shè)置的很小了，而且 table-extension 應(yīng)該怎么寫在文件中，大小如何設(shè)置呢？ waring2:lincs waring relative constraint deviation after lincs : rms 503.186673 .max 23064.251953 (between atom 1420 and 1421) bonds that rotated more than 30 degrees 請教各位高手這種問題如何處理，我實(shí)在是沒法了。。。。 |
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zhongyunxia
新蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 化工熱力學(xué)和基礎(chǔ)數(shù)據(jù)
2樓2011-11-29 16:33:57
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