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如何將.cdx變成真正的mol2格式？
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大家?guī)臀铱匆幌�，我在進(jìn)行分子對(duì)接的時(shí)候，用openbabel將.cdx轉(zhuǎn)化成了mol2格式，并將所有的文件放入.mdb的文件夾中了，但是我在用MSS將這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)打開時(shí)，發(fā)現(xiàn)了下面的問題，里面顯示的所有文件竟然是.cdx格式的了，請(qǐng)高手幫我解答，以下附上我的問題截圖以及一張正確的圖 這是錯(cuò)誤的 我想現(xiàn)在的問題可能是我的openbabel的問題了，大家平時(shí)都是怎么轉(zhuǎn)換格式的呢？ [ Last edited by shouling on 2011-12-5 at 14:27 ] |
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2樓2011-12-07 11:56:29
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shouling(金幣+2): 也是，以前好用來著，現(xiàn)在不行了，我就采用你們的方法吧 2011-12-09 16:00:05
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我沒有用過openbabel轉(zhuǎn)換。說不定存在某種bug。 還是信賴chemoffice自己的轉(zhuǎn)換吧。建議將cdx的在chem3d中存為mol2格式。畢竟經(jīng)由同一個(gè)軟件轉(zhuǎn)換出錯(cuò)的概率低一些。把已經(jīng)轉(zhuǎn)換的mol2格式的文件試著用chem3d打開，看看是不是有什么不妥，再次保存為mol2也許就可以了。 |
3樓2011-12-09 15:14:11
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