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kattygirl鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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計(jì)算Cl-在Fe表面吸附問(wèn)題時(shí)體系加電荷方法
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計(jì)算Cl-離子在Fe表面吸附時(shí)，我的算法是對(duì)cl原子加一個(gè)負(fù)電荷后，對(duì)整個(gè)體系賦予-1價(jià)，幾何優(yōu)化、能量計(jì)算后、結(jié)果計(jì)算出的吸附能為正值。 想請(qǐng)大俠們幫忙解決一下，這是哪方面的問(wèn)題，會(huì)導(dǎo)致最后的吸附能為正值。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
uuv2010(金幣+2): 多謝指導(dǎo)！ 2011-12-15 23:49:57
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uuv2010(金幣+2): 多謝指導(dǎo)！ 2011-12-15 23:49:57
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首先說(shuō)，MS是個(gè)大雜燴，雖然很方便但也容易出現(xiàn)誤會(huì)。比如你們討論的這個(gè)設(shè)置原子電荷的功能，并不一定是針對(duì)dmol或castep模塊的設(shè)置。所以在使用這些設(shè)置之前，一定要看好幫助文件中的介紹。 另外關(guān)于體系中的離子，其實(shí)第一原理就是尋找體系基態(tài)的過(guò)程，至于體系中的到底是離子還是原子，則需要看計(jì)算出來(lái)的電子得失情況。帶電體系也是一樣，就比如樓主的離子，cl原子吸附到Fe，你對(duì)體系加了一個(gè)電子，那么軟件就會(huì)自動(dòng)尋找這個(gè)電子最穩(wěn)定分布。有可能是分布在cl原子上，使之成為離子。亦有可能是分布到Fe-slab上。究竟是那種情況，自然是要聽(tīng)從軟件的計(jì)算結(jié)果。 限制這個(gè)電子停留在Cl上，我不知道意義何在，因?yàn)樵趯?shí)際的實(shí)驗(yàn)中你也不能保證這個(gè)電子始終停留在Cl上而沒(méi)有轉(zhuǎn)移到別處吧～ |
14樓2011-12-15 23:34:45
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2樓2011-12-09 02:04:33
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非常感謝您的幫助，首先我用的計(jì)算公式是：吸附能=（能量計(jì)算后）吸附體系的總能量—清潔Fe(100)的能量—Cl-的能量，計(jì)算Cl-的能量時(shí)我是把cl原子加一個(gè)負(fù)電荷后放到10埃的立方盒子里面，幾何優(yōu)化、能量計(jì)算后得出的。其次，對(duì)于這種帶電體系，對(duì)于加電荷的方式我不知道我這樣對(duì)不對(duì)，但是我覺(jué)得為了保證電荷守恒，加一個(gè)帶負(fù)電荷的氯離子在鐵表面上，那么體系不是也應(yīng)給再賦予給它一個(gè)負(fù)電荷嗎？ 希望您能指點(diǎn)我一下，萬(wàn)分感謝！ |
3樓2011-12-10 21:10:23
acridine
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sunyang1988(金幣+3): 謝謝指點(diǎn) 2011-12-11 09:26:08
sunyang1988(金幣+3): 謝謝指點(diǎn) 2011-12-11 09:26:08
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第一個(gè)，關(guān)于公式，最好能有相關(guān)的參考文獻(xiàn)對(duì)比。因?yàn)楸容^帶電體系能量的時(shí)候需要進(jìn)行能級(jí)的alignment，以使得能量具有可比性。這個(gè)過(guò)程在計(jì)算帶電缺陷形成能的時(shí)候經(jīng)常出現(xiàn)，不知道研究帶電吸附的時(shí)候有沒(méi)有類(lèi)似的過(guò)程，找下相關(guān)文章吧。 第二個(gè)問(wèn)題。首先，因?yàn)橛行⿻r(shí)侯離子是一種比較化學(xué)的、定性的描述，而實(shí)際體系中并不一定是這樣的帶電原子形式存在的。所以要先明確你模擬的體系是否真的是這種帶負(fù)電的Cl原子參與。 另外就是模型的意義和合理性。我們想要模擬的是無(wú)限固體Fe表面的吸附，但由于計(jì)算的限制，我們只能建立吸附位置附近的結(jié)構(gòu)模型。如果此時(shí)如果你讓模型帶電，那么其實(shí)模擬的是：電荷局域在吸附位置附近的情況。而實(shí)際上，即使真的有額外電荷引入，可能也不會(huì)局限在吸附位置附近，尤其這里的Fe還是導(dǎo)體。那么你的模型的合理性就有待商榷了。 以上只是我的看法了，我也沒(méi)有具體研究過(guò)吸附，只當(dāng)做建議就好了。  |
4樓2011-12-11 00:48:00
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