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bubuweiying金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
官能團(tuán)電荷
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| 高斯中官能團(tuán)的電荷是指官能團(tuán)中各原子電荷(Mulliken charges)的相加么,如COOH的電荷是指C,O,O,H四個(gè)原子電荷的總和么,謝謝啊 |

金蟲(chóng) (小有名氣)
小笨蛋精靈

至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
| 我認(rèn)為可以這么相加,但mulliken電荷不是太準(zhǔn)確啊。你可以看看這個(gè)帖子,可能對(duì)你有幫助。http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2456809 |

版主 (著名寫(xiě)手)
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高斯中官能團(tuán)的電荷可以是指官能團(tuán)中各原子電荷(Mulliken charges)的相加。 但這還是比較粗略,因?yàn)镸ulliken charges有些缺點(diǎn)。 對(duì)如-COOH的電荷,是C,O,O,H四個(gè)原子凈電荷的總和。 它還是可以體現(xiàn)出-COOH拉過(guò)來(lái)一些電荷,并且在-COOH分配了。 在有機(jī)化學(xué)同系物中比較時(shí),Mulliken charges的誤差還可以作為系統(tǒng)誤差有所抵消。 這種電荷雖然不夠精確,但還不是經(jīng)驗(yàn)理論的“形式電荷”。 但是我想如果做R-COOH與-R和-COOH的電子密度差,可能-COOH上拉過(guò)來(lái)的電荷會(huì)比較準(zhǔn)確。Gsgrid會(huì)自動(dòng)計(jì)算-COOH空間拉過(guò)來(lái)的電荷,避免Mulliken charges的缺點(diǎn)。 [ Last edited by zhou2009 on 2011-12-13 at 10:53 ] |
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
本人已永久離開(kāi)小木蟲(chóng)
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官能團(tuán)的電荷可以通過(guò)原子電荷相加來(lái)計(jì)算,然而計(jì)算原子電荷方法多種多樣(可參見(jiàn)此文http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml),因此計(jì)算官能團(tuán)電荷的方法也多種多樣,沒(méi)有唯一的定義。而在一些力場(chǎng)里,比如gromos力場(chǎng)中,COOH基團(tuán)的電荷則被精確定義為0。 定義官能團(tuán)絕對(duì)的電荷值任意性很大。而正如zhou2009所說(shuō),橫向比較不同化合物中相同官能團(tuán)的電荷變化趨勢(shì)可以很大程度上掩蓋住不同電荷模型定義間的任意性,在物理和實(shí)際意義上也更明確。 也有不通過(guò)原子電荷加和方法來(lái)獲取官能團(tuán)電荷的做法。直接積分官能團(tuán)空間內(nèi)的密度差是一種,另一種是給不同基團(tuán)定義基團(tuán)電負(fù)性,然后通過(guò)電負(fù)性均衡原理來(lái)獲得不同化學(xué)環(huán)境中的官能團(tuán)電荷。 |
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