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求助30872185摘要
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至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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代謝組動態(tài)指紋圖譜的統(tǒng)計特征提取及數(shù)據(jù)分析方法研究 負責(zé)人:李康 參與人:李康, 劉艷, 孫敏, 馬葆華, 李貞子, 武曉巖, 武振宇, 趙發(fā)林, 孫萌, 張濤 金額:33萬 申請時間:2008 學(xué)科代碼:流行病學(xué)方法與衛(wèi)生統(tǒng)計(H2611) 項目批準號:30872185 申請單位:哈爾濱醫(yī)科大學(xué) 研究類型:應(yīng)用基礎(chǔ)研究 關(guān)鍵詞:代謝組學(xué);指紋圖譜;模式識別;特征提取 由代謝組動態(tài)指紋譜,可以研究機圖體在外界刺激或基因表達改變的影響下隨時間變化的代謝模式特征,辨識和解析被研究對象的生理和病理狀態(tài)。對于代謝組數(shù)據(jù)的分析,主要問題是相對于給定的樣品數(shù)目譜峰的數(shù)量巨大,同時代謝組分濃度含量極微,變動范圍可寬達7~9個數(shù)量級,其數(shù)據(jù)具有非常復(fù)雜的特性。本研究主要針對的是,代謝組動態(tài)指紋圖譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理、變量選擇、因果關(guān)系網(wǎng)絡(luò)、綜合特征提取及結(jié)果可視化幾方面的問題。具體內(nèi)容包括:用小波分析方法實現(xiàn)代謝組數(shù)據(jù)的分解與重構(gòu)、譜峰識別、重疊信號解析、基線漂移校正、弱信號檢出;用于特征選擇的動態(tài)隨機森林模型(RF)的構(gòu)造及算法;探討揭示代謝組分受特征因子調(diào)控和具有因果關(guān)系的動態(tài)貝葉斯網(wǎng)絡(luò)模型(DBN);評價獨立成分分析(ICA)和自組織特征映射(SOM)對特征變量降維及可視化效果;研制新算法的統(tǒng)計軟件。本研究將為代謝組數(shù)據(jù)分析提供更為有效的統(tǒng)計模型及數(shù)據(jù)分析方法。 |
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