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cfmzxf84木蟲 (正式寫手)
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[求助]
GOLD對接，得分是越高越好還是越低越好
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請教，GOLD對接打分的時候，chemscore打分是正的10左右，和文獻(xiàn)報道的配體位置較相近。請問正常嗎？ 我以前對接的（不成功）打分基本上都是負(fù)數(shù)。 GOLDscore打分是越正越好，chemscore表示的是能量，一般表示能量不都是越負(fù)越好嗎？ 有點糊涂 另外，請教，其他幾個函數(shù)的打分也是越正越好嗎？謝謝 |
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【答案】應(yīng)助回帖
★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
cfmzxf84(金幣+8): ★★★很有幫助 我也是做的redock，打分波動蠻大的，同樣的運(yùn)算，最高的一次也才26，是不是參數(shù)沒設(shè)置好呢？ 謝謝 2011-12-21 16:33:38
御劍江湖(金幣+1): 樓主已獎勵，同樣謝謝 2011-12-21 18:42:20
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
cfmzxf84(金幣+8): ★★★很有幫助 我也是做的redock，打分波動蠻大的，同樣的運(yùn)算，最高的一次也才26，是不是參數(shù)沒設(shè)置好呢？ 謝謝 2011-12-21 16:33:38
御劍江湖(金幣+1): 樓主已獎勵，同樣謝謝 2011-12-21 18:42:20
| GOLD對接Chemscore打分過去我晶體結(jié)構(gòu)中的配體分子Redock做RMSD，好的構(gòu)象打分都是40多到50多都有，虛篩的分子打分我都選高分的，不會是負(fù)值的 |
2樓2011-12-21 15:35:45
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