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muye1001金蟲 (小有名氣)
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[求助]
AUTODOCK求助
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情況是這樣的，我在進(jìn)行分子對(duì)接，然后對(duì)接完之后，我查看DLG文件，查看最低能量 LOWEST ENERGY DOCKED CONFORMATION from EACH CLUSTER ___________________________________________________ Keeping original residue number (specified in the input PDBQ file) for outputting. MODEL 99 USER Run = 99 USER Cluster Rank = 1 USER Number of conformations in this cluster = 100 USER USER RMSD from reference structure = 62.221 A USER USER Estimated Free Energy of Binding = -5.94 kcal/mol [=(1)+(2)+(3)-(4)] USER Estimated Inhibition Constant, Ki = 44.53 uM (micromolar) [Temperature = 298.15 K] USER USER (1) Final Intermolecular Energy = -5.94 kcal/mol USER vdW + Hbond + desolv Energy = -5.97 kcal/mol USER Electrostatic Energy = +0.03 kcal/mol USER (2) Final Total Internal Energy = +0.00 kcal/mol USER (3) Torsional Free Energy = +0.00 kcal/mol USER (4) Unbound System's Energy = +0.00 kcal/mol 下劃線的三項(xiàng)為什么全變成0了，能解釋下為什么嗎，因?yàn)樯弦粋�(gè)分子算的時(shí)候還不為0呢,是不是我哪操作出錯(cuò)了 [ Last edited by muye1001 on 2011-12-15 at 10:35 ] |
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4樓2011-12-22 08:53:08
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2樓2011-12-16 13:57:37
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3樓2011-12-21 07:52:04
chaizhm: 編輯內(nèi)容 2012-04-02 18:48
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1 [ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:48 ] |
5樓2012-04-02 17:29:29
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