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蛋白modelling找到活性變化的原因
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為了驗(yàn)證或者改變目標(biāo)蛋白的底物特異性，做了幾個(gè)突變，hplc看到該酶的特異性有所變化，但是一個(gè)突變居然使其活性降低了至少10倍，我想通過蛋白modelling的方法來找出催化活性降低的原因。 請各位高手不吝指教。比如用啥軟件來做modelling？如何預(yù)測ligand等等。 我的蛋白沒有結(jié)晶，但是相同功能的蛋白已經(jīng)有晶體結(jié)構(gòu)。 謝謝��！ |
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amms_8
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2樓2011-12-29 08:43:05
3樓2011-12-29 16:18:23
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4樓2011-12-29 17:18:04
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
huiee(金幣+5): ★★★很有幫助 2011-12-30 20:57:46
huiee(金幣+1): DS是 docking server？ 2011-12-30 20:58:56
huiee(金幣+5): ★★★很有幫助 2011-12-30 20:57:46
huiee(金幣+1): DS是 docking server？ 2011-12-30 20:58:56
| DS、PP軟件可以用于點(diǎn)突變之后的模建，網(wǎng)上有同源模建swiss-model，但是它是根據(jù)序列同源性預(yù)測的，估計(jì)不會得到你想要的結(jié)果DS和PP雖然是收費(fèi)的，但是也有破解版的，只是版本低點(diǎn)，但是在預(yù)測方面還是沒有障礙的�？梢砸辉嚒� |
5樓2011-12-30 13:17:25
imyting
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6樓2011-12-30 21:43:49
7樓2011-12-30 21:59:54
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