topten-gg

銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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[求助] 使用pwscf計(jì)算這個(gè)單胞的話(huà) 怎么數(shù)單胞中的原子數(shù)？

REMARK Materials Studio PDB file
REMARK Created:  Tue Jan 03 14:07:02 ora solare Europa occidentale 2012
CRYST1 16.780 16.780 2.459  90.00  90.00 120.00 P1
ATOM    1  C MOL    2    7.774 2.633 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    2  C MOL    2    5.336 5.786 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    3  C MOL    2    7.440 4.002 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    4  C MOL    2    7.067 4.605 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    5  C MOL    2    3.930 5.891 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    6  C MOL    2    3.242 5.723 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    7  C MOL    2    5.992 5.517 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    8  C MOL    2    1.584 4.442 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    9  C MOL    2    2.043 4.982 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    10  C MOL    2    1.703 0.458 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    11  C MOL    2    1.050 3.137 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    12  C MOL    2    0.997 2.431 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    13  C MOL    2    2.778  -0.453 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    14  C MOL    2    3.434  -0.722 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    15  C MOL    2    1.331 1.061 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    16  C MOL    2    5.528  -0.660 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    17  C MOL    2    4.840  -0.828 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    18  C MOL    2    6.728 0.081 1.055  1.00  0.00          C
ATOM    19  C MOL    2    7.186 0.622 2.285  1.00  0.00          C
ATOM    20  C MOL    2    7.721 1.926 2.285  1.00  0.00          C
TER

新手接觸固體物理很茫然
謝謝大家

直接用nat=20 ntyp=1？

謝了

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【其他】pwscf中的原胞體積計(jì)算！已經(jīng)有4人回復(fù)

1樓 2012-01-03 22:22:43

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phq323

至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227(金幣+1): 感謝提示~~有幫助 2012-01-04 09:53:19
topten-gg(金幣+2): 謝謝你這個(gè)是triclinic ab相等不等于c alphabeta為90 gamma120 2012-01-04 18:45:14

可以這樣設(shè)的，nat=20。
這個(gè)晶胞不是一個(gè)PWSCF默認(rèn)的FCC、BCC、SC等標(biāo)準(zhǔn)的晶胞，需要自己設(shè)置。

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2樓2012-01-04 09:17:18

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souledge

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227(金幣+1): 感謝交流~~ 2012-01-04 14:24:44
topten-gg(金幣+3): ★★★很有幫助 2012-01-04 18:41:12

直接把CASTEP的*.cell文件中BLOCK LATTICE_CART部分作為PWscf中的CELL_PARAMETER，再把BLOCK POSITIONS_FRAC中的部分作為PWscf的ATOMIC_POSITIONS不就可以了么……

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3樓2012-01-04 14:17:15

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引用回帖:

樓: Originally posted by souledge at 2012-01-04 14:17:15:
直接把CASTEP的*.cell文件中BLOCK LATTICE_CART部分作為PWscf中的CELL_PARAMETER，再把BLOCK POSITIONS_FRAC中的部分作為PWscf的ATOMIC_POSITIONS不就可以了么……

castep里面 cell parameter的單位是angstrom
atomic position的單位是什么呢？

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4樓2012-01-04 18:54:32

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WDD880227(金幣+1): 感謝交流 2012-01-05 08:57:26

引用回帖:

4樓: Originally posted by topten-gg at 2012-01-04 18:54:32:
castep里面 cell parameter的單位是angstrom
atomic position的單位是什么呢？

各種單位，參見(jiàn)DOC/中PW的幫助文件~

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5樓2012-01-04 20:25:33

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goldenfisher

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★
fzx2008(金幣+1): 謝謝指教 2012-01-04 21:01:06

在轉(zhuǎn)換CASTEP到PWSCF的原子坐標(biāo)時(shí)，要注意選擇的是incell原子坐標(biāo)，否則在pwscf中會(huì)出現(xiàn)原子重疊的現(xiàn)象。

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6樓2012-01-04 20:29:16

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tongji888

禁蟲(chóng) (小有名氣)

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7樓2012-01-05 21:40:26

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liliangfang(金幣+1): 多謝指教 2012-01-06 10:34:24

引用回帖:

7樓: Originally posted by tongji888 at 2012-01-05 21:40:26:
怎么確定自己選擇的是不是incell的原子呢？請(qǐng)教。。。

輸出格式為.car即可看到了

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8樓2012-01-06 10:30:20

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