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dxjdmy

木蟲 (正式寫手)

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[求助] NBO分析求助

小蟲想請教與NBO相關(guān)的幾個問題，望大蝦提供幫助，謝謝
1、用NB03.1進(jìn)行NBO分析時，我想求Cr-Cr的鍵級，結(jié)果如下：

Wiberg bond index matrix in the NAO basis:

   Atom 1    2    3    4    5    6    7    8    9
   ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
1. Cr  0.0000  1.2548  0.7388  0.1990  0.8038  0.0798  0.1054  0.0112  0.0703
2. Cr  1.2548  0.0000  0.1599  0.7153  0.1238  0.9458  0.0508  0.0025  0.1178
這是矩陣，但是下面有一個總的
Wiberg bond index, Totals by atom:

   Atom 1
   ---- ------
1. Cr  5.7579
2. Cr  5.8196
接著下面還有一個NAO bond order

Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:

   Atom 1    2    3    4    5    6    7    8    9
   ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
1. Cr  0.0000  0.8210  0.6598  0.1777  0.7056  0.0758  0.0098  0.0092 -0.0074
2. Cr  0.8210  0.0000  0.0819  0.6396  0.1208  0.7436  0.0024  0.0014  0.0248
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order, Totals by atom:

   Atom 1
   ---- ------
1. Cr  3.7968
2. Cr  3.7606

接著下面還有一個矩陣：
MO bond order:

   Atom 1    2    3    4    5    6    7    8    9
   ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
1. Cr  0.0000 -0.0612  0.4004 -0.2270  0.0568 -0.1499  0.2370 -0.0294  0.1786
2. Cr -0.0612  0.0000  0.1090  0.1352 -0.1210  0.0589 -0.0299  0.0500 -0.0819

①、總共三種鍵級，到底選哪一種比較好？②比如，如果選擇NAO bond order，到底選擇矩陣中對角線的數(shù)值還是選擇total by atoms中相應(yīng)原子后面的那個數(shù)值？？③為什么wiberg bond order、NAO bond order、MO bond order三個數(shù)值差別這么大，MO bond order 的鍵級甚至已經(jīng)到負(fù)值了？？
2、在文獻(xiàn)上看到進(jìn)行NRT分析時，得到的Natural Bond Order矩陣中，所得的鍵級并不是整數(shù)，而我用GenNBO5.0W進(jìn)行NRT分析時得到的Natural Bond Order矩陣中，所得的鍵級都是整數(shù)，是什么原因呀？？？
請各位大俠幫忙，萬分感謝！

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1樓 2012-01-04 15:30:20

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tiechong

金蟲 (著名寫手)

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zhou2009:編輯內(nèi)容 2012-01-06 08:50
zhou2009(金幣+2): 2012-01-06 08:51:05

wiberg bond order、NAO bond order都行, MO bond order 就不要用了, 很不靠譜。

[ Last edited by zhou2009 on 2012-1-6 at 08:50 ]

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回復(fù)此樓

2樓2012-01-06 00:17:22

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