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muxiachuixue木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何從電子云密度判斷反應(yīng)活性位點(diǎn)？
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RT，據(jù)說(shuō)可以通過(guò)電子云密度的計(jì)算來(lái)得知一個(gè)化合物的親核、親電位點(diǎn)，不知如何操作。論壇里面說(shuō)用cubegen生成density.cube，但是我用GV顯示圖形的時(shí)候就是一坨啊 ，無(wú)法判斷，所以請(qǐng)教高手，我該如何通過(guò)計(jì)算電子云密度來(lái)判斷化合物反應(yīng)的活性位點(diǎn)？以下附上我要研究的化合物結(jié)構(gòu)，研究目的是找出哪一個(gè)羥基更容易發(fā)生糖苷化反應(yīng)。 |
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muxiachuixue
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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3樓2012-01-07 20:02:23
yjcmwgk
禁蟲(chóng) (文壇精英)
密度泛函·小卒
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990(金幣+2): 2012-01-07 17:00:04
muxiachuixue(金幣+5): ★★★很有幫助 2012-01-07 20:02:30
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990(金幣+2): 2012-01-07 17:00:04
muxiachuixue(金幣+5): ★★★很有幫助 2012-01-07 20:02:30
誰(shuí)跟你說(shuō)通過(guò)計(jì)算電子云密度來(lái)直接判斷化合物反應(yīng)的活性位點(diǎn)的？你去打他一頓吧。 電子云密度確實(shí)可以用來(lái)判斷活性位點(diǎn)，但是你要自己做處理呀。  比如通過(guò)電子密度差分計(jì)算，來(lái)得到Fukui函數(shù)和Condensed Hardness/Softness。這些都是概念密度泛函的東西。可以看Phys. Chem. Chem. Phys., 2011, 13, 13277–13286這篇文章的Computational details這部分的第三自然段。 |
2樓2012-01-07 13:49:03
yoghurt117
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4樓2012-01-07 22:26:28
vigaryang
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5樓2012-01-08 02:39:36
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